โรงเรียนวัดองครักษ์ได้ผ่านมาตราฐานโรงเรียนต้นแบบ "สุขาดี มีความสุข" ของสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสุพรรณบุรี เขต 1 และได้รับเกียรติบัตรโรงเรียนต้นแบบ "สุขาดี มีความสุข" ของกระทรวงศึกษาธิการ 

โรงเรียนวัด​องครักษ์​ได้รับเกียรติ​บัตรเป็นโรงเรียนอีโคสคูล (Eco-school) ระดับต้น (ปี 2566 – 2569) จาก กรมส่งเสริมคุณภาพสิ่งแวดล้อม​  กระทรวง​ทรัพยากรธรรมชาติ​และสิ่งแวดล้อม