SAP Kepulauan Waigeo Sebelah Barat

Tutupan karang di SAP Waigeo Sebelah Barat masuk dalam kategori cukup baik. Berdasarkan survei yang telah dilakukan, kondisi karang yang ada cenderung stabil, sehingga dapat disimpulkan bahwa tidak ada gangguan signifikan terhadap tutupan karang di sekitar kawasan SAP Waigeo Sebelah Barat

Ikan karang merupakan salah satu indikator dalam suatu ekosistem karang. Keberadaan ikan karang dapat memberikan arti terhadap kesehatan ekosistem terumbu karang. Dari 22 jenis ikan indikator dari kelompok Chaetodontidae yang paling mendominasi yaitu Chaetodon lunulatus (162 ind/Ha), Chaetodon trifascialis (90 ind/Ha) dan Chaetodon kleinii (86 ind/Ha).

Kelimpahan megabenthos sangat berpengaruh pada kesehatan karang. Keberadaan megabenthos mempunyai arti penting dalam proses rantai makanan dan ekologi. Megabenthos indikator yang paling mendominasi adalah jenis kima dan siput drupella dengan persentase masing masing 41.54% dan 40%.

Pari Manta juga dijumpai pada Suaka Alam Perairan Waigeo, di mana lagun di sekitar Pulau Wayag merupakan nursery area bagi pari manta, dan merupakan nursery area pertama di Asia Tenggara. Pada lokasi tersebut, ditemukan agregasi dari pari manta hamil serta pari manta juvenille, sehingga dapat disimpulkan bahwa lokasi tersebut merupakan nursery area dari pari manta.

Mangrove merupakan salah satu ekosistem penting kaitannya dengan kelimpahan sumberdaya ikan. Ekosistem mangrove merupakan salah satu area pemijahan bagi beberapa jenis komoditas ikan penting seperti udang, kepiting, kakap mangrove, dan ikan-ikan lain yang berperan dalam kesehatan ekosistem lainnya. Ekosistem mangrove di kawasan SAP Waigeo Sebelah Barat berada di gugusan Pulau Bag, Pulau Uranie. Pulau In, dan Kepulauan Wayag.

Suaka Alam Perairan Waigeo merupakan salah satu kawasan yang memiliki potensi perikanan yang cukup tinggi. Meningkatnya biomassa ikan pada setiap tahunnya mengindikasikan potensi perikanan yang cukup besar di dalam kawasan SAP Waigeo Sebelah Barat. Sasi merupakan salah satu aturan adat sub Suku Sawe yang memiliki hak ulayat di SAP Waigeo Sebelah Barat. Bentuk aturan adat tersebut terbagi menjadi Buka Sasi (masyarakat boleh tangkap) dan Tutup Sasi (masyarakat dilarang menangkap).