Ο Σταύρος Αυγολούπης γεννήθηκε το 1949 στη Μεγάλη Παναγία Χαλκιδικής και τελείωσε τις γυμνασιακές σπουδές του στην Αρναία Χαλκιδικής. Έλαβε πτυχίο από το Τμήμα Μαθηματικών, όπου ήταν υπότροφος του Ιδρύματος Κρατικών Υποτροφιών (ΙΚΥ), για την επίδοσή του στις σπουδές του και Διδακτορικό Δίπλωμα από το Τμήμα Φυσικής του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης (βαθμός «Άριστα») με επιβλέποντα του Διδακτορικού του τον καθηγητή της Γεωδαιτικής Αστρονομίας του Τμήματος Αγρονόμων Τοπογράφων Μηχανικών της Πολυτεχνικής Σχολής του ΑΠΘ και Ιδρυτή και Διευθυντή του Αστεροσκοπείου Στεφανίου Κορινθίας κ. Λυσίμαχο Μαυρίδη.

Το Μάιο 1975 διορίστηκε στο Εργαστήριο Αστρονομίας του Τμήματος Φυσικής, το οποίο για 32 χρόνια υπηρέτησε διδακτικά και ερευνητικά, στην ερευνητική κατεύθυνση «Παρατηρησιακή Αστρονομία» έως το 2007, που μετακινήθηκε στο Παιδαγωγικό Τμήμα Δημοτικής Εκπαίδευσης του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης στην ερευνητική κατεύθυνση «Παρατηρησιακή Αστρονομία και η Αστρονομία στην Εκπαίδευση», από το 2007 έως το 2016, που συνταξιοδοτήθηκε, συνεχίζοντας όμως και κατά το διάστημα αυτό την ερευνητική του κυρίως συνεργασία με το Τμήμα Φυσικής. Διήλθε όλες τις πανεπιστημιακές βαθμίδες εξέλιξης στο Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης, το οποίο υπηρέτησε χωρίς καμία διακοπή για 41 ολόκληρα έτη και του απενεμήθη ομόφωνα ο τίτλος του Ομότιμου Καθηγητή του Τμήματος Φυσικής της Σχολής Θετικών Επιστημών του ΑΠΘ.

Έχει γράψει περισσότερες από 100 πρωτότυπες επιστημονικές εργασίες δημοσιευμένες σε έγκριτα Διεθνή Περιοδικά με κριτές και σε Πρακτικά Διεθνών Συνεδρίων με κριτές, 15 βιβλία για φοιτητές, εκπαιδευτικούς, μαθητές και για το ευρύ κοινό, 7 κεφάλαια σε Συλλογικούς Τιμητικούς Πανεπιστημιακούς Τόμους, 21 εργασίες σε Συνέδρια και Ελληνικά Περιοδικά με κριτές τους εκδότες τους ή τις επιτροπές έκδοσής των και περισσότερες από 50 εργασίες για κοινωνική προσφορά. Το επιστημονικό αυτό έργο του έχει σημαντική διεθνή αναγνώριση με περισσότερες από 1000 αναφορές άλλων ερευνητών στο ερευνητικό έργο του.

Στα πλαίσια της ερευνητικής του δραστηριότητας είχε ενεργό ρόλο και στις δυο κορυφαίες επιτυχίες του αστεροσκοπείου Στεφανίου, δηλαδή στη πρώτη (και έως σήμερα τη μοναδική) ανακάλυψη κύκλου δραστηριότητας (πενταετούς) σε άλλον αστε΄ρα εκτός του Ηλίου μας, καθώς και στη πρώτη διεθνώς επιτυχημένη καταγραφή ηλιακής έκλαμψης σε άλλον αστέρα πέραν και πάλι απ' τον Ήλιο, και συγκεκριμένα σε αστέρα της μεγάλης κατηγορίας μεταβλητών αστέρων RS CVn. Η καταγραφή της έκλαμψης πραγματοποιήθηκε τόσο απ' το αστεροσκοπείο Στεφανίου όσο κι απ' τον Ιαπωνικό δορυφόρο GINGA στις ακτίνες Χ και όπως δήλωσε και η ίδια η Διεθνής Αστρονομική Ένωση (IAU) άνοιξε νέους ορίζοντες στη μελέτη μεταβλητών αστέρων.