โครงสร้างความรู้ระดับองค์กร กกท. มี 7 กลุ่มดังนี้

1. กลุ่มความรู้ด้านการกีฬา

2. กลุ่มความรู้การพัฒนากีฬาเป็นเลิศ

3. กลุ่มความรู้ด้านธุรกิจกีฬา

4. กลุ่มความรู้ด้านวิศวกรรมกีฬา

5. กลุ่มความรู้ด้านวิทยาศาสตร์การกีฬา

6. กลุ่มความรู้ด้านการควบคุมการใช้สารต้องห้ามทางการกีฬา

7. กลุ่มความรู้งานสนับสนุน