齋藤    雄太朗

齋藤 雄太朗

助教 –Small Molecule G–

専門分野:化学生物学、有機合成化学

研究キーワード:有機合成化学、脂質科学、生体イメージング

学歴

2009年–2013年       名古屋大学 理学部化学科

2013年–2015年       名古屋大学大学院 理学研究科物質理学専攻(化学系)博士前期課程(伊丹健一郎 教授)

2015年–2018年       名古屋大学大学院 理学研究科物質理学専攻(化学系)博士後期課程(伊丹健一郎 教授)

2018年3月                   博士号(理学)取得

職歴

2013年–2015年       名古屋大学博士課程教育リーディング大学院プログラムRA

2015年–2018年       日本学術振興会   特別研究員(DC1)

2018年–2019年       東京大学大学院工学系研究科化学生命工学専攻     特任研究員(山東信介 教授)

2019年–2019年       理化学研究所 環境資源科学研究センター 分子生命制御研究チーム   基礎科学特別研究員(萩原伸也 チームリーダー)

2019年–現在             東京大学大学院工学系研究科化学生命工学専攻   助教(現職)

その他

2016年     留学:米国カリフォルニア工科大学(Prof. Brian M. Stoltz)

2016年      野依フォーラム若手育成塾第2期生

発表論文

(17) "Pimonidazole-alkyne conjugate for sensitive detection of hypoxia by Cu-catalyzed click reaction"

Iori Tamura, Daichi M. Sakamoto, Bo Yi, Yutaro Saito, Naoki Yamada, Yoichi Takakusagi, Shinsuke Sando*

Anal. Sci., 2024, DOI: 10.1007/s44211-024-00520-y

(16) "Whole-body and whole-organ 3D imaging of hypoxia using activatable covalent fluorescent probe compatible with tissue clearing"

Daichi M. Sakamoto, Iori Tamura, Bo Yi, Sho Hasegawa, Yutaro Saito, Naoki Yamada, Yoichi Takakusagi, Shimpei I. Kubota, Hiroshi Harada, Kenjiro Hanaoka, Masayasu Taki, Masaomi Nangaku, Kazuki Tainaka*, and Shinsuke Sando*

ACS Nano 2024, 18, 5167–5179. DOI: 10.1021/acsnano.3c12716

ChemRxiv 2023, DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-brfdm

(15) "Label-free quantification of passive membrane permeability of cyclic peptides across lipid bilayers: Penetration speed of cyclosporin A across lipid bilayers"

Takahiro Ono, Kazuhito V. Tabata, Yuki Goto, Yutaro Saito, Hiroaki Suga, Hiroyuki Noji, Jumpei Morimoto* and Shinsuke Sando*

Chem. Sci. 2023, 14, 345349. DOI: 10.1039/D2SC05785A

(14) "C–H Borylation of Arenes: Steric-controlled Para-selectivity and Application to Molecular Nanocarbons"

Yasutomo Segawa*, Mai Nagase, Yutaro Saito, Kenta Kato, and Kenichiro Itami*

J. Synth. Org., Jpn. 2022, 80,994–999. DOI: 10.5059/yukigoseikyokaishi.80.994

(13) "Structure-guided design enables development of a hyperpolarized molecular probe for the detection of aminopeptidase N activity in vivo"

Yutaro Saito, Hiroyuki Yatabe, Iori Tamura, Yohei Kondo, Ryo Ishida, Tomohiro Seki, Keita Hiraga, Akihiro Eguchi, Yoichi Takakusagi, Keisuke Saito, Nobu Oshima, Hiroshi Ishikita, Kazutoshi Yamamoto, Murali C. Krishna,* Shinsuke Sando*

Sci. Adv. 2022, 8, eabj2667. DOI: 10.1126/sciadv.abj2667

(12) "Structure-based relaxation analysis reveals C-terminal [1-13C]glycine-d2 in peptides has long spin-lattice relaxation time that is applicable to in vivo hyperpolarized magnetic resonance studies"

Yohei Kondo, Yutaro Saito, Tomohiro Seki, Yoichi Takakusagi, Jumpei Morimoto, Hiroshi Nonaka, Koichiro Miyanishi, Wataru Mizukami, Makoto Negoro, Abdelazim Elsayed Elhelaly, Fuminori Hyodo, Masayuki Matsuo, Natarajan Raju, Rolf Swenson, Murali C. Krishna, Kazutoshi Yamamoto, and Shinsuke Sando

ChemRxiv 2022, DOI: 10.26434/chemrxiv-2022-tfkk1.

(11)Evaluation of enzymatic and magnetic properties of γ-glutamyl-[1-13C]glycine and its deuteration toward longer retention of the hyperpolarized state"

Yohei Kondo, Yutaro Saito, Abdelazim Elsayed Elhelaly, Fuminori Hyodo, Tatsuya Nishihara, Marino Itoda, Hiroshi Nonaka, Masayuki Matsuo, and Shinsuke Sando

RSC Adv. 2021, 11, 37011–37018. DOI: 10.1039/D1RA07343E


(10) Regulation of cadherin dimerization by chemical fragments as a trigger to inhibit cell adhesion"

Akinobu Senoo, Sho Ito, Satoru Nagatoishi, Yutaro Saito, Go Ueno, Daisuke Kuroda, Kouhei Yoshida, Takumi Tashima, Shota Kudo, Shinsuke Sando, and Kouhei Tsumoto

Commun. Biol. 2021, 4, 1041. DOI: 10.1038/s42003-021-02575-3


(9) “Structural basis for selective inhibitor of human serine hydroxymethyltransferase by secondary bile acid conjugate"

Tomoki Ota‡, Akinobu Senoo‡, Masumi Shirakawa‡, Hiroshi Nonaka, Yutaro Saito, Sho Ito, Go Ueno, Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto, and Shinsuke Sando

iScience, 2021, 24, 102036. DOI: 10.1016/j.isci. 2021.102036

   

(8) “In vivo detection of γ-glutamyl-transferase up-regulation in glioma using hyperpolarized γ-glutamyl-[1-13C]glycine”

Georgios Batsios, Chloé Najac, Peng Cao, Pavithra Viswanath, Elavarasan Subramani, Yutaro Saito, Anne Marie Gillespie, Hikari A.I. Yoshihara, Peder Larson, Shinsuke Sando, Sabrina M. Ronen

Sci. Rep. 2020, 10, 6244. DOI: 10.1038/s41598-020-63160-y


(7) “Synthesis of Polybenzoacenes by Annulative Dimerization of Phenylene Triflate through Twofold C‐H Activation”

Mizuho Uryu, Taito Hiraga, Yoshito Koga, Yutaro Saito, Kei Murakami, and Kenichiro Itami

Angew. Chem., Int. Ed. 2020, 59, 1–5. DOI: 10.1002/anie.202001211


(6) “Selective Transformation of Strychnine and 1,2-Disubstituted Benzenes by C–H Borylation”

Yutaro Saito, Kotono Yamanoue, Yasutomo Segawa, and Kenichiro Itami

Chem 2020, 6, 1–9. DOI:10.1016/j.chempr.2020.02.004


(5) “Design strategy for serin hydroxymethyltransferase probe based on retro-aldol-type reaction”

Hiroshi Nonaka, Yuki Nakanishi, Satoshi Kuno, Tomoki Ota, Kentaro Mochidome, Yutaro Saito, Fuminori Sugihara, Yoichi Takakusagi, Ichio Aoki, Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto, and Shinsuke Sando

Nat. Commun. 2019, 10, 876. DOI: 10.1038/s41467-019-08833-7


(4)  “Synthesis of partially and fully fused polyaromatics by annulative chlorophenylene dimerization”

Yoshito Koga, Takeshi Kaneda, Yutaro Saito, Kei Murakami, and Kenichiro Itami

Science 2018, 359, 435–439. DOI: 10.1126/science.aap9801


(3) “(R)- and (S)-2,2’-Bis(3,5-dimethylphenylphosphino)-6,6’-dimethoxy-1,1’-biphenyl” 

Yutaro Saito, Yasutomo Segawa, and Kenichiro Itami

e-EROS 2017. DOI: 10.1002/047084289X.rn02052


(2)  “Flexible Reaction Pocket on Bulky Diphosphine−Ir Complex Controls Regioselectivity in para-Selective C−H Borylation of Arenes”

Brandon E. Haines, Yutaro Saito, Yasutomo Segawa, Kenichiro Itami, and Djamaladdin G. Musaev

ACS Catal. 2016, 6, 7536–7546. DOI: 10.1021/acscatal.6b02317


(1) “para-C−H Borylation of Benzene Derivatives by a Bulky Iridium Catalyst”

 Yutaro Saito, Yasutomo Segawa, and Kenichiro Itami

J. Am. Chem. Soc. 2015, 135, 5193–5198. DOI: 10.1021/jacs.5b02052

受賞

2016年   第32回 有機合成化学セミナー 優秀ポスター賞

2020年   第36回 井上研究奨励賞

2020年   量子生命科学会第2回大会優秀発表賞

2022年   量子生命科学会 若手優秀賞

2022年    有機合成化学協会 コニカミノルタ研究企画賞

所属学会

日本化学会、日本薬学会、有機合成化学協会、量子生命科学会

招待・依頼講演等

(5) 「生体分子の代謝や多様性の理解に資する分子プローブおよび合成法の開発」、関西学院大学理工生命学部講演会(村上彗研究室)、2023年11月10日、関西学院大学三田キャンパス

(4) 「生体内アミノペプチダーゼ活性を可視化する超偏極核磁気共鳴分子プローブの開発」、第17回メタボロームシンポジウム、2023年10月19日、神奈川県川崎市殿町国際戦略拠点キングスカイフロント

(3) 「精密分子設計による生体応用可能な分子プローブの開発」、第50回 日本核磁気共鳴医学会大会、2022年9月9日、名古屋国際会議場

(2) 「生体内アミノペプチダーゼN活性を検出・可視化する量子超偏極核磁気共鳴分子プローブの開発」、量子生命科学会 第4回大会、若手優秀賞受賞講演、2022年5月27日、神戸大学

(1) "Development of hyperpolarized molecular probes for in vivo detection of peptidase activities", THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2021, 2021/12/22, online