Romero-Arias J. Roberto, PhD
Investigador Asociado "C", Interino
Universidad Nacional Autónoma de México
Instituto de Investigaciones en Matemáticas
Aplicadas y en Sistemas (IIMAS)
roberto.romero@aries.iimas.unam.mx
romero@mym.iimas.unam.mx
jrromeroarias@gmail.com
Sobre mi
Desde hace tiempo me he interesado en el desarrollo herramientas y lenguajes comunes entre varias disciplinas científicas, en las que destacan la física, las matemáticas y la biología. Esto con la finalidad de crear puentes multidisciplinarios entre el continuo crecimiento de estas disciplinas y la necesidad de fortalecer ideas comunes para mejorar la interpretación de muchos sistemas complejos. En ese sentido, la investigación que desarrollo se centra en estudiar los mecanismos que dan origen a diferentes procesos del desarrollo en los sistemas vivos, particularmente la evolución del cáncer y los procesos de diferenciación celular en plantas. Las herramientas que usualmente ocupo están asociadas a los comportamiento de las redes complejas a través de redes de regulación genética, sistemas dinámicos no lineales y, programación y simulación numérica.
Temas de Interés
⊙ Biología Matemática ⊙ Fenómenos de interfase
⊙ Morfogénesis en plantas y animales ⊙ Termodinámica y procesos de transporte
⊙ Cáncer ⊙ Física estadística
⊙ Sistemas dinámicos ⊙ Análisis, programación y simulación numérica
⊙ Sistemas complejos ⊙ Diseño experimental
⊙ Formación de patrones ⊙ Divulgación de la Ciencia
Oportunidades para hacer Investigación
⊙ Becas para estudiantes de licenciatura en las áreas de física, matemáticas. Tema a desarrollar: Transiciones de fase, termodinámica fuera de equilibrio y ecuación de Langevin.
⊙ Becas para estudiantes de licenciatura en las áreas de física, matemáticas, biología o campos a fines. Tema a desarrollar: Efectos epigenéticos en el desarrollo de cáncer, organogénesis y propiedades elásticas. Conocimiento en ecuaciones diferenciales ordinarias y programación numérica.
⊙ Estudiantes de maestría y doctorado únanse a nuestro grupo de investigación desarrollando técnicas de modelado, caracterización matemática de espacios-fase y modelos multiescala para comprender los efectos genéticos y epigenéticos en la organogenésis y el desarrollo de cáncer.
Investigación
⊙ J. Roberto Romero-Arias, Alberto S. Luviano, Miguel Costas, A Hernandez-Machado, Rafael A. Barrio. Interfacial viscoelastic in oscillating drops of cyclodextrin-surfactant aqueous solution: experiments and theory. Soft Matter 20, 9240-9248 (noviembre 2024).
⊙ Joshua Briones-Andrade, Guillermo Ramírez-Santiago, J. Roberto Romero-Arias. A mathematical model for pancreatic cancer during intraepithelial neoplasia. Royal Society Open Science 11:240702 (octubre 2024).
⊙ J. Roberto Romero-Arias, Carlos A. González-Castro, Guillermo Ramírez-Santiago. A multiscale model of the role of microenvironmental factors in cell segregation and heterogenety in breast cancer development. PLoS Comput Biol 19(11):e1911673 (noviembre2023).
⊙ Josep Ferre-Torres, Adria Noguera-Monteagudo, Adrian Lopez-Canosa, J. Roberto Romero-Arias, Rafael Barrio, Oscar Castaño, Aurora Hernandez- Machado. Chemotactic sprouting of endothelial cells through an extracellular matrix. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology 11:1145550 (junio 2023).
⊙ Andreu F. Gallen, J. Roberto Romero-Arias, Rafael A. Barrio, Aurora Hernández Machado. Vesicle formation induced by thermal fluctuations. Soft Matter , 19(16), 2908-2918. (marzo 2023).
⊙ J. Roberto Romero-Arias, Alberto S. Luviano, Miguel Costas, Aurora Hernández Machado, Rafael A. Barrio. Dynamical shapes of droplets of cyclodextrin-surfactant solutions. Scientific Reports 12, 5252 (abril 2022).
⊙ M. D. Rueda-Contreras, A. F. Gallen, J. Roberto Romero-Arias, A. Hernández-Machado, R. A. Barrio. On Gaussian curvature and membrane fission. Scientific Reports (2021).
⊙ J. Roberto Romero-Arias, A. S. Luviano, M. Costas, A. Hernández-Machado, R. Barrio. Dipole-dipole interactions control the interfacial rheological response of cyclodextrins/surfactant solutions. Soft Matter http://dx.doi.org/10.1039/D0SM01796E (2021).
⊙ J. Roberto Romero-Arias, Guillermo Ramírez-Santiago, Jorge X. Velasco- Hernández, Laurel Ohm, Maribel Hernández-Rosales. Model for breast cancer diversity and spatial heterogeneity. Phy. Rev. E, 98(3):032401 (2018).
⊙ Mara D. Rueda Contreras, José R. Romero-Arias, José L. Aragón, Rafael A. Barrio. Curvature-driven spatial patterns in growing 3D domains: a mechanochemical model for phyllotaxis. PLoS ONE 13(8): e0201746 (2018).
⊙ Osvaldo Osuna, Diana Piñango-Juárez, J. R. Romero-Arias. Global asymptotic stability for epidemiological models with general incidence rate. Sociedad Matemática Mexicana, Memorias 14(2018).
⊙ Hernández-Hernández V, Barrio Rafael A, Benítez M, Nakayama Naomi, Romero-Arias José Roberto, Villarreal Carlos. A physico-genetic module for the polarisation of auxin efflux carriers PIN-FORMED (PIN). Physical Biology 15(3), 036002 (2018).
⊙ Romero-Arias JR, Henández-Hernández V, Benítez M, Alvarez-Buyllla E, Barrio A. Model of polar auxin transport coupled to mechanical forces retrieves robust morphogenesis along the Arabidopsis root. Phys. Rev. E 95, 032410 Editor’ Suggestion (2017).
⊙ Barrio RA, Orozco-Fuentes S, Romero-Arias R. Modelling the Early Growth of Stem Cell Tissues. World Scientific, (2016).
⊙ Barrio RA, Romero-Arias JR, Noguez MA, Azpeitia E, Ortiz-Gutierrez E, et. al. Cell Patterns Emerge from Coupled Chemical and Physical Fields with Cell Proliferation Dynamics: The Arabidopsis thaliana Root as a Study System. PLoS Comput Biol 9(5). (2013).
⊙ Barrio RA, Hernandez-Machado A, Varea C, Romero-Arias JR, Alvarez- Buylla E. Flower Development as an Interplay between Dynamical Physical Fields and Genetic Networks. PLoS ONE 5(10) (2010).
⊙ J. Roberto Romero-Arias, Rafael A. Barrio, Elena Álvarez-Buylla, Carmen Varea, Aurora Hernández-Machado. Modelo de diferenciación celular en la floración de Arabidopsis thaliana. TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas, 13(2):86-97, (2010).
⊙ Romero Arias, José Roberto; La física en la diferenciación celular: Arabidopsis thaliana. Revista Digital Universitaria [en línea]. 1 de junio 2010, Vol. 11, No.6.
⊙ G.G. Naumis and J.R. Romero-Arias. The problem of glass formation and low frequency vibrational modes anomalies. Revista Mexicana de Física, 56 (2), 97-105 (2010).
⊙ J.R. Romero-Arias, F. Salazar Posadas, G.G. Naumis, G. Fernández-Anaya, Thermal conductivity, relaxation and low frequency vibrational modes in non-linear Hamiltonians: an application to glass modelling, Philosophical Transactions of the Royal Society A 367, 3173-3181 (2009).
⊙ J.R. Romero-Arias, Gerardo G. Naumis, Thermal relaxation and low- frequency vibrational anomalies in simple models of glasses. A study using nonlinear Hamiltonians, Phys. Rev. E 77, 061504 (2008).
Eventos
⊙ Coordinador del Coloquio IIMAS. Desde junio de 2023.
⊙ Coorganizador del Coloquio Conjunto de Matemáticas Aplicadas de la Sociedad Matemática Mexicana. Desde marzo de 2023--diciembre 2023.
⊙ Organizador del Coloquio de Matemáticas Aplicadas del departamento de Matemáticas y Mecánica. Marzo 2022--diciembre 2023.
⊙ Coorganizador de la XXII Escuela de Otoño de Biología Matemática y XVI Encuentro de Otoño de Biología Matemática. Octubre 2021.
⊙ Organizador de la Sesión Especial de Biología Matemática en el LI Congreso Nacional de Matemáticas en el marco del año internacional de la Biología Matemática. Octubre 2018.
Estudiantes
Doctorado
⊙ Jesús Ramírez. Proyecto: Sostenibilidad ambiental. PCM, en proceso.
⊙ Melissa Romero. Proyecto: Modelación epigenética para el diagnóstico y la prevención del desarrollo de cáncer. PCM, en proceso.
Maestría
⊙ Carlos Álvarez. Proyecto: Organogénesis y la transición epitelio-mesinquimo como regulador de propiedades mecánico-elásticas y químicas. PCF, en proceso.
⊙ Melissa Romero. Proyecto: Modelo matemático para el diagnóstico, la prevención y la reversión del desarrollo temprano de cáncer colorrectal. PCM, terminado.
Licenciatura
⊙ Jhony Lazcano. Proyecto: Dinámica celular y matricial en la angiogénesis. Fac. Ciencias, en proceso.
⊙ Joshua Briones. Proyecto: Modelo cuantitativo de la evolución de cáncer de páncreas. Fac. Ciencias, en proceso.
⊙ Ana Pineda. Dinámica con retardo en el desarrollo de adenocarcinamo de pulmon. Fac. Ciencias, en proceso.
Servicio Social
⊙ Ana Pineda. Redes de interacción genética en enfermedades. Fac. Ciencias, Terminado.
⊙ Gretchen Rincón. Modelos socioculturales para el uso sustentable de recursos. Fac. Ciencias, en proceso.
Divulgación
Plática: Luchas invisibles en el desarrollo de enfermedades. XIII Congreso de la Sociedad Latinoamericana de Biología Matemática. Universidad de Sonora. Noviembre 2024.
Plática: Transiciones topológicas y patrones espaciales potenciados por la curvatura. Mathematical Trends in Operator Theory, PDE and Mathematical Physics IIMAS-UNAM. Julio 2024.
Plática: Modelo multiescala para entender el cáncer. Primer seminario de Física y Matemáticas, Universidad Autónoma de Guerrero. Febrero 2023.
Plática: Efectos epigenéticos en la evolución de cáncer. Seminario del Departamento de Matemáticas del Instituto Tecnológico Autónomo de México. Noviembre 2022.
Plática: Efectos epigenéticos en el desarrollo de cáncer. III Taller de Matemáti- cas Aplicadas, Universidad de Sonora. Marzo 2022.
Plática: Interacciones multiescala en el desarrollo temprano de cáncer. Seminario de Sistemas Complejos del Instituto de Física, Universidad Nacional Autónoma de México. Octubre 2021.
Plática: Interacciones ecológicas y sociales relacionadas con la obtención de agua dulce. SIAM Reunión anual de la Sección México. Junio 2021.
Plática: Efectos epigenéticos durante el desarrollo de cáncer de mama. Seminario multidisciplinario de la Facultad de Ciencias, Universidad Autónoma del Estado de México. Febrero 2021.
Plática: Microambiente celular y evolución de cáncer. Sesión de Biología Matemática en el LII Congreso Nacional de Matemáticas. Octubre 2019.
Plática: Efectos espaciales en el desarrollo de cáncer de mama. Coloquio del Departamento de Matemáticas y Mecánica, Instituto de Investigaciones en Matemáticas Aplicadas y en Sistemas, Universidad Nacional Autónoma de México. Septiembre 2019.
Plática: Turing y el origen de las plantas. XVIII Escuela de Verano, Centro de Ciencias Matemáticas, Universidad Nacional Autónoma de México. Junio 2018.
Plática: Modelando el desarrollo temprano de las plantas con flores. Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo. Mayo 2018.
Plática: Mundo pequeño, matemáticas y cáncer. Degustaciones Matemáticas. Facultad de Ciencias, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo. Abril 2018.
Plática: Crecimiento de células cancerígenas. Seminario de Física Estadística. Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México. Marzo 2018. ( https://youtu.be/v69Xm-yfoqM )
Plática: Mutaciones y proliferación celular anómala. Seminario de Investigación. Universidad Autónoma de Guerrero. Noviembre 2017.
Plática: Crecimiento de células cancerígenas. Seminario de Biomatemáticas. Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo. Octubre 2017.
Plática: Modelos de proliferación celular en las raíces de las plantas. Seminario de Biomatemáticas. Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo. Mayo 2017.
Plática: Crecimiento de células cancerígenas bajo la lupa matemática. Seminario de Matemáticas en Informática. Universidad Autónoma de Querétaro. Marzo 2017.
Artículo de divulgación: Células troncales y cura de enfermedades. Revista Magazine Querétaro. Columna Núm 150. Edición 929. Febrero 2017.
Expositor de experimentos de física en la 2da Muestra de Experimentos. Marzo 2016.
Expositor de experimentos de física en el Día de Puertas Abiertas del Instituto de Física. Noviembre 2015.
Charla Magia o física en la Fiesta de las Ciencias y Humanidades. Octubre 2015.
Expositor de experimentos de física en la Fiesta de las Ciencias y las Humanidades. Octubre 2015.
Expositor de experimentos de física en la Feria Internacional del Libro en el Palacio de Minería. (Febrero 2015, 2013, 2011).
Cursos impartidos
⊙ Semestre 2025-1. Posgrado Ciencias Matemática, UNAM.
Ecuaciones Diferenciales Ordinarias
⊙ Semestre 2025-1. Posgrado Ciencias Físicas, UNAM.
Física Biológica
⊙ Semestre 2023-1, 2023-2, 2024-1 y 2024-2. Facultad de Ciencias, UNAM.
Ecuaciones Diferenciales Ordinarias I
⊙ Semestre 2022-2. Posgrado en Ciencias Matemáticas, UNAM.
Temas Selectos de Ecuaciones Diferenciales. Modelación Matemática de Sistemas Biológicos
⊙ Semestre 2022-1. Posgrado en Ciencias Matemáticas, UNAM.
Temas Selectos de Ecuaciones Diferenciales. Modelación de Sistemas Biológicos y epidemias
⊙ Semestre 2021-2. Posgrado en Ciencias Matemáticas, UNAM.
Curso avanzado de sistemas continuos. Modelación espacial de epidemias
⊙ Semestre 2021-1. Posgrado en Ciencias Matemáticas, UNAM.
Curso avanzado de sistemas continuos. Modelación matemática de sistemas biológicos
⊙ Semestre 2020-2. Posgrado en Ciencias Matemáticas, UNAM.
Introducción a los medios continuos
⊙ Semestre 2019-2. PCCM UNAM-UMSNH.
Modelación matemática de sistemas continuos
⊙ Semestre 2019-2. Ingeniería Ambiental-UMSNH
Física
⊙ Semestre 2019-1. PCCM UNAM-UMSNH.
Seminario de medios continuos
⊙ Semestre 2019-1. Ingeniería Ambiental-UMSNH
Física