Más de cien exhibiciones han tenido lugar en las 3 galerías itinerantes del MAPR, ubicadas en el 4to nivel del museo, ala este. Dos galerías de igual tamaño, 5,000 pies cuadrados cada una, ubican en las alas norte y sur del edificio contemporáneo, y una galería de menor tamaño dedicada principalmente a muestras de corte experimental. Grandes exhibiciones retrospectivas, de artistas puertorriqueños y visitantes, se han presentado en estas galerías que cuentan con el apoyo de los siguientes benefactores: Bertita y Guillermo L. Martínez, Miguel Antonio Ferrer y RJ Reynolds.
Vista de la exhibición 'Pulguero' de Víctor Vázquez, 2017.
Entrada a la exhibición 'Domingo García. Obra selecta en 60 años 1947-2007', presentada en el 2007.
Exhibición 'Puerto Rico: Geografía humana', 2009.
Llegada al MAPR de la obra 'Borges o el Aleph' del artista Francisco Rodón, 2015.
Exhibición de ganadores de la beca Lexus para artistas 2015-2016, 'Encuentros paralelos'.
Vista parcial de la exhibición 'Contemporánea Internacional: Nuevos coleccionistas en Puerto Rico', 2018.
Conferencia dentro de la exhibición digital 'VIAL' celebrada en el 2013.
En el año 2002 se presentó la muestra 'Pintura naíf del Museo Internacional de Arte Naíf Anatole Jakovsky'.
'Al que nace pa' martillo...' de Milton Rosa Ortiz se presentó en el 2006.
En el 2004 se presentó la exhibición 'Henry Klumb y la exhuberancia poética en la arquitectura'.
'Artista interrumpida: selección de obras de Mari Mater O'Neill - Del post al después' se presentó en el 2007.