Родился 23 июля 1967 года в селе Левокумское Ставропольского края Российской СФСР (село Левокумское, Ставропольский край, Российская Федерация).

26 октября 1985 года Ставропольским районным военным комиссариатом призван на воинскую службу.

2 февраля 1986 года отправлен из города Грозный Российской СФСР (город Грозный, Чеченская Республика, Российская Федерация) в город Кабул Республики Афганистан, а затем в город Гардез Республики Афганистан, где служил в должности топливозаправщика (рядовой, старший водитель войсковой части полевой почты № 44585) в роте материального обеспечения специализированной десантно-штурмовой бригады.

С 5 февраля 1986 года по 21 ноября 1987 года служил в Республике Афганистан.

Награжден медалью "Воину-интернационалисту от благодарного афганского народа".

Гарафонов Юрий Анатольевич // Афганистан. Страницы мужества : воинам-интернационалистам Могилевской области посвящается / под общей редакцией В. Н. Василенко ; редколлегия: В. Ф. Ванькович [и др.]. — Могилев, 2019. — С. 318.

Гарафонов Юрий Анатольевич // И память сердца говорит… : альбом / ГУК "Централизованная сеть публичных библиотек Славгородского района". — Славгород, [2000?]. — С. 34 : портр., ил.

Городецкая, В. Уважение и благодарность воинам-интернационалистам / Виктория Городецкая // Прысожскі край (Слаўгарад). — 2025. — 15 лютага. — С. 2 : іл.

Юрий Гарафонов, воин-интернационалист, инвалид первой группы.

Рыженкова, С. Ушел в армию, а попал на войну : 35 лет памяти / Светлана Рыженкова // Прысожскі край (Слаўгарад). — 2024. — 10 лютага. — С. 1, 7 : іл.

Юрий Анатольевич Гарафонов, воин-интернационалист, житель г. Славгород Могилевской области.

Часть 1, Часть 2