Родился 13 октября 1964 года в городском поселке Хотимск Могилевской области. Белорус. В 1980 году окончил 8 классов Хотимской средней школы № 2, в 1981 году — ПТУ № 70 города Могилев, в 1984 году — ПТУ № 21 в городском поселке Хотимск.
15 октября 1984 года Хотимским райвоенкоматом Могилевской области призван в ряды Вооруженных Сил, службу проходил в войсковой части 51087.
В феврале 1985 года направлен в Афганистан в войсковую часть полевая почта 93992. Был радиотелефонистом.
18 апреля 1985 года рядовой В. В. Лисеенко, выполняя боевое задание, погиб.
Похоронен в городском поселке Хотимск Могилевской области.
За мужество и героизм посмертно награжден орденом Красной Звезды, медалью "Воину-интернационалисту от благодарного афганского народа" и Грамотой Президиума Верховного Совета СССР.
Лісеенка Віктар Віктаравіч // Памяць. Афганістан / галоўны рэдактар А. Л. Петрашкевіч. — Мінск, 1991. — С. 261.
Лисеенко Виктор Викторович // Республиканская книга Памяти воинов-интернационалистов / Г. П. Пашков (гл. редактор) [и др.]. — Минск, 1999. — С. 381 : фото.
Петров, А. Боль и память матери : [встреча с Александрой Александровной Лисеенко, мамой Виктора Лисеенко, воина-интернационалиста, погибшего в Афганистане] / А. Петров // Шлях кастрычніка (Хоцімск). — 2020. — 19 лютага. — С. 5 : фото.