Con la derrota de la invasión fantasma de Morro, los ninjas se han convertido en grandes celebridades mediáticas. Pero fuerzas oscuras amenazan una vez más la isla NINJAGO cuando la Tetera de Tyrahn es redescubierta por el fantasma de Clouse, la antigua mano derecha del Maestro Chen. Él permite que Nadakhan, un Djinn malvado (Genio), y capitán del infame Misfortune's Keep, escape de la tetera. Después de reunir a su tripulación pirata, Nadakhan regresa a su reino natal y reino de Djinjago, para encontrarlo derrumbándose. Esta destrucción, causada por los ninjas que derrotaron al Preeminente, lleva a Nadakhan a jurar venganza. Reacondiciona su barco para que pueda volar y se prepara para atacar. Ahora son Piratas del Cielo.