Zane reprograma sin querer su computadora interna, lo que provoca que se borre toda su memoria. Los ninjas deciden utilizar los recuerdos que guardan sus propios trajes mecánicos para refrescarle la memoria a Zane, pero un misterioso virus se infiltra en el sistema y amenaza con borrar a Zane para siempre. Los ninjas deberán revivir sus momentos más épicos y enfrentarse a sus peores enemigos del pasado para salvar a su amigo