สำนักงานคณบดี

1. ฝ่ายการคลัง

2. ฝ่ายการศึกษา

3. ฝ่ายทรัพยากรบุคคล

4. ฝ่ายนโยบายและแผน

5. ฝ่ายวิศวกรรมบริการและอาคารสถานที่

   1. งานบำบัดน้ำเสีย

6. ฝ่ายสารสนเทศ

7. ฝ่ายทรัพย์สินและพัสดุ

8. ฝ่ายวิจัย

9. งานการศึกษาระดับหลังปริญญา

10. งานกิจการนักศึกษา

11. งานคุณธรรมและจริยธรรม

12. งานจัดการความรู้

13. งานบริหารทรัพยากรสุขภาพ

14. งานบริหารและธุรการ

15. งานสื่อสารองค์กร

16. งานพัฒนาคุณภาพ

17. งานวิชาการ

18. งานวิเทศสัมพันธ์

19. งานสร้างเสริมสุขภาพ

20. งานหอสมุดศิริราช

21. งานกิจกรรมเพื่อสังคม

22. งานบริหารความเสี่ยงและควบคุมภายใน

23. งานองค์กรสัมพันธ์และกิจการพิเศษ

ภาควิชา

1. ภาควิชากายวิภาคศาสตร์

2. ภาควิชากุมารเวชศาสตร์

3. ภาควิชาจักษุวิทยา

4. ภาควิชาจิตเวชศาสตร์

5. ภาควิชาจุลชีววิทยา

6. ภาควิชาชีวเคมี

7. ภาควิชาตจวิทยา

8. ภาควิชานิติเวชศาสตร์

9. ภาควิชาปรสิตวิทยา

10. ภาควิชาพยาธวิทยา

11. ภาควิชาพยาธิวิทยาคลินิก

12. ภาควิชาเภสัชวิทยา

13. ภาควิชารังสีวิทยา

14. ภาควิชาวิทยาภูมิคุ้มกัน

15. ภาควิชาวิสัญญีวิทยา

16. ภาควิชาเวชศาสตร์การธนาคารเลือด

17. ภาควิชาเวชศาสตร์ฉุกเฉิน

18. ภาควิชาเวชศาสตร์ป้องกันและสังคม

19. ภาควิชาเวชศาสตร์ฟื้นฟู

20. ภาควิชาศัลยศาสตร์

21. ภาควิชาศัลยศาสตร์ออร์โธปิดิคส์และกายภาพบำบัด

22. ภาควิชาสรีรวิทยา

23. ภาควิชาสูติศาสตร์-นรีเวชวิทยา

24. ภาควิชาโสต นาสิก ลาริงซ์วิทยา

25. ภาควิชาอายุรศาสตร์

26. สถานการแพทย์แผนไทยประยุกต์

27. สถานเทคโนโลยีการศึกษาแพทย์ศาสตร์

28. โรงเรียนกายอุปกรณ์สิรินธร

29. ศูนย์โรคหัวใจสมเด็จพระบรมราชินีนาถ

30. สถานวิทยามะเร็งศิริราช

โรงพยาบาล

1. สำนักงานผู้อำนวยการโรงพยาบาลศิริราช

2. ฝ่ายการพยาบาล

3. ฝ่ายเภสัชกรรม

4. ฝ่ายโภชนาการ

5. งานบริหารคลินิกพิเศษ

6. งานเคลื่อนย้ายผู้ป่วย

7. งานทันตกรรม

8. งานบริการผ้า

9. งานบริการสุขภาพปฐมภูมิศิริราช

10. งานเปลี่ยนอวัยวะศิริราช

11. งานพิษวิทยา

12. งานโภชนศาสตร์คลินิก

13. งานโรคติดเชื้อ

14. งานเวชภัณฑ์ปลอดเชื้อ

15. งานเวชระเบียน

16. งานสังคมสงเคราะห์

17. งานสิทธิประกันสุขภาพ

18. งานอาชีวอนามัย

19. งานอุปกรณ์ทางการแพทย์

20. งานออกแบบและควบคุมการก่อสร้าง

21. งานระบบแก๊สทางการแพทย์

1. ด้านวิทยาศาสตร์การกีฬา 

2. ด้านสุขศึกษา 

3. ด้านอาชีวอนามัย 

4. ด้านสถิติทางการแพทย์

5. ด้านเวชระเบียน 

6. ด้านการบำบัดน้ำเสีย 

7. ด้านวิเทศสัมพันธ์ 

8. ด้านกิจกรรมเพื่อสังคม 

9. ด้านทรัพยากรบุคคล