Bệnh viện Phạm Ngọc Thạch được thành lập từ năm 1906, ban đầu là một bệnh viện tư nhân và mang tên bệnh viện Drouhet. Cái tên Drouhet được đặt theo F. Drouhet lúc đó giữ chức Thị trưởng thành phố Chợ Lớn (le maire de la ville de Cholon). Trải qua thời gian, bệnh viện Drouhet đổi tên thành Bệnh viện Lê Văn Thịnh, Bệnh viện Hồng Bàng, Trung tâm lao và bệnh phổi Phạm Ngọc Thạch và đến nay mang tên Bệnh viện Phạm Ngọc Thạch.

Bệnh viện Phạm Ngọc Thạch là Bệnh viện hạng I, cấp chuyên môn kỹ thuật cấp chuyên sâu về Lao và Bệnh Phổi trực thuộc Sở Y tế thành phố Hồ Chí Minh. Theo Quyết định phân công công tác chỉ đạo tuyến trong lĩnh vực khám, chữa bệnh, ban hành kèm theo Quyết định số 4026/QĐ-BYT ngày 20 tháng 10 năm 2010 của Bộ trưởng Bộ Y tế, bệnh viện Phạm Ngọc Thạch là bệnh viện đầu ngành, phụ trách chỉ đạo tuyến trong lĩnh vực khám, chữa bệnh cho chuyên khoa Lao và Bệnh Phổi các tỉnh/thành phố Miền Nam.