Используемые при отборе проб материалы могут быть источником загрязнения. Поэтому их необходимо утилизировать должным образом, чтобы предотвратить попадание загрязняющих веществ в окружающую среду. Способы утилизации используемых при отборе проб материалов зависят от типа материалов. Некоторые материалы, такие как пластик и стекло, можно перерабатывать. Другие материалы, такие как фильтровальная бумага и активированный уголь, должны быть утилизированы как опасные отходы.