Основой, своего рода каркасом,  палеовулкана Хоба-Тепе служат две пластовые вулканические толщи общей мощностью более 800 м. Первая (нижняя) слагает часть Берегового хребта на всем его протяжении. Она состоит из налегающих друг на друга потоков лав основного и среднего состава мощностью более 600 м. Ее основание скрыто под водами Черного моря. Вулканических туфов очень мало, а в ряде мест их и вовсе нет. Вторая вулканическая толща резко отличается от первой с преобладанием вулканических туфов над лавами и более кислым составом вулканических продуктов. Это довольно мощная (до 240 м.) толща грубообломочных туфов характерного зеленовато-серого цвета с несколькими потоками лав среднего, средне основного и кислого состава.