分子生物資訊實驗室

實驗室進行中的計畫：

1. 癌症演化與抗藥性分析： 開發癌症演化歷程分析工具，探討癌症演化過程中與藥物抗性及放射治療抗性（Radio-resistance）相關的關鍵基因變異。

2. lncRNA 調控預測： 開發長鏈非編碼 RNA（lncRNA）調控標的預測工具，深入探討癌症內部的轉錄體調控失衡現象。

3. 癌症預後模型建構： 利用美國癌症基因體圖譜（The Cancer Genome Atlas, TCGA）資料庫中的轉錄體與基因體數據，建立癌症預後預測（Prognosis）模型。

4. ChIP-seq 分析工具開發： 開發染色質免疫沉澱定序（ChIP-seq）資料分析工具，專門針對非模式生物（Non-model organisms）的表觀遺傳學資料進行分析。

對外合作計畫 ：

1. 跨體學資料整合： 與長庚大學分子醫學研究中心合作，開發能整合跨基因體、轉錄體及蛋白質體數據的綜合分析工具。

2. 致病細菌與宿主交互作用： 與長庚醫院腎臟科合作，探討鉤端螺旋體（Leptospira）感染後，宿主細胞內的轉錄體變化及其致病機制。

3. 競爭性內源 RNA 網絡： 與 Baylor College of Medicine 研究員合作，利用公開資料庫數據，深入探討細胞內競爭性內源 RNA（ceRNA）之間的相互調控與競爭關係。

4. 多重抗藥性細菌基因體研究： 與臺北醫學大學微免學科合作，透過全基因體定序（WGS）技術，探討臨床分離之多重抗藥性（MDR）細菌株的基因體變異特徵。