ศูนย์เครื่องมือฯ มีภารกิจหลักคือการให้บริการห้องปฏิบัติการ เครื่องมือวิทยาศาสตร์ เพื่อสนับสนุนการเรียนการสอนรายวิชาปฏิบัติการและวิจัยของมหาวิทยาลัย โดย มีกลุ่มห้องปฏิบัติการหลัก ดังนี้ 

1. ห้องปฏิบัติการเคมี

2. ห้องปฏิบัติการจุลชีววิทยา

3. ห้องปฏิบัติการชีววิทยา

4. ห้องปฏิบัติการฟิสิกส์

5. ห้องปฏิบัติการทางด้านอาหาร