O Órgão da Cripta do Santuário de Nossa Senhora da Assunção de Vilas Boas foi originalmente construído pela firma Walker para a Igreja Evangélica de Paul Gerhardt em Wellesweiler na Alemanha em 1964. Este instrumento, com características neo-barroco, é composto por 1786 tubos distribuídos por dois manuais e uma pedaleira. 

A 4 de setembro de 2020 é oficializada a compra entre a comunidade alemã e o Santuário. Pelas 16 horas do dia 26 de setembro, o órgão chega ao seu futuro local. Instalado pela JMS Organaria entre outubro de 2020 e janeiro de 2021, teve um custo total de €70.327,50 suportadas pelo Município de Vila Flor e por dois benfeitores.

Foi benzido na festa da Ascensão do Senhor (16 de maio de 2021) por D. José Cordeiro tendo, nesse mesmo dia, o concerto inaugural pelo organista Marcos Brescia e a soprano Rosana Orsini.

Disposição

Afinação 442 hz a 21ºC
Temperamento Igual

Grande Órgão (I teclado, c1-g5)
1. Pommer 16'
2. Prinzipal 8'
3. Gemshorn 8'
4. Oktave 4'
5. Rohrflöte 4'
6. Nasard 2 2/3'
7. Fachflöte 2'
8. Mixtur 4-6 fach
9. Trompete 8'

Pedal (c1-f5)
10. Subbaß 16'
11. Oktavbaß 8'
12. Gedecktbaß 8'
13. Choralbaß 4'
14. Quintade 4'
15. Baszink 4 fach
16. Fagott-Pos. 16'

Positivo (II Manual, c1-g5)
17. Gedeckt 8'
18. Nachhorn 4'
19. Prinzipal 2'
20. Quinte 1 1/3'
21. Terz 1 3/5'
22. Scharffzimbel 3 fach
23. Rakett 16'
24. Rohrschalmey 8'
25. Tremulant

II-I
I - Ped.
II - Ped.