O Prestes Vestibulares nasceu em 1999 a partir de iniciativas de estudantes da USP, e alunos recém-saídos do ensino médio de escolas públicas de Carapicuíba. Percebendo que muitos alunos egressos de escolas públicas não tinham condições de arcar com as despesas de um cursinho pré-vestibular comercial, e que desejosos de cursar uma universidade não tinham condições de competir com os filhos das elites, passaram a buscar apoio de pessoas sensibilizadas com os anseios do grupo.