植物の機能ゲノム研究により、様々な遺伝子の構造と機能の関係が解明され、それぞれの遺伝子が成長をどのように制御しているかが統合的に理解されつつあります。実用作物固有の遺伝子についても、どのような遺伝子が存在し、その進化のメカニズムはどのようなものであるかが多くの情報によって明らかにされています。

　特定の品種の特性を決定する遺伝子が明らかになれば、塩基配列情報を用いて優れた遺伝子を持つ個体を選択することが可能となり、育種作業がより科学的かつ効率的に進められるでしょう。