主角Q是一个学业成绩一般的国三生，却他一直有个志愿：便是成为世界第一的名侦探。

而当Q得知其居住的城市有一间专门培训侦探的学校“DDS”后，他便前往“DDS”的入学考试会场。而Q并于进行“DDS”入学考试试验途中结识了拥有“瞬间记忆能力”的女孩美南惠、拥有异于常人能力的铁汉远山金太郎和天才程序员的小学生鸣泽数马，并一同四人进行入学考试试验。

然而当Q等人正进行“DDS”最后试验时，Q并于进行试验途中认识了天才美少年天草流。其后当Q等人经过“DDS”的校长团守彦的一连串试验后，众人却被其安排入读学园的特别班，展开一段全新的侦探学园生活。