CENTAUR
CENTAUR(Central Taiwan Advanced Universal Research Suite ,中臺先進通用研究套件)係由中臺科技大學開發之生物資訊整合套件。其命名源自人馬座,寓意人類智慧(精準演算法)與強大算力(運算效能)的深度融合,為一款開源且免費的分析平台。CENTAUR 除具備序列檢索、多重比對、蛋白質模圖(Motif)與結構域(Domain)識別及二級結構預測、三級結構展示等核心功能外,亦整合了多元的統計分析工具,為研究者提供全方位的一站式分析方案。
CENTAUR 目前處於優化階段 (CENTAUR is currently in the debug phase)
若在使用中發現錯誤,請不吝聯繫開發者,以協助我們優化軟體品質。(If you encounter any errors or have suggestions for improvement, please feel free to contact the developer.)
Ver. 1.47g | Developer: chengnan77@gmail.com
Extract sequence :提取部份序列
Format Sequence:轉換序列格式為 FASTA或 MSF
Genomic insight:基因組全局地圖分析
Gen-proteomic insight:基因蛋白組全局地圖分析
Merge seq (Auto):自動化拼接序列
Merge seq (Manual):手動拼接序列
M.W. analysis:計算核苷酸分子量
ORF prediction:ORF 預測
Pattern search:搜尋特定序列並計算出現頻率
Plot ORF:ORF 互動式預測
Primer check:引子檢查
Primer design:引子設計簡易版 (建議改用 Primer-blast)
Random sequence:隨機生成序列
Repeat Masking:重複序列識別
Restriction Enzyme:限制內切酶分析
Reverse sequence:反轉與互補序列
RFLP analysis:PCR-RFLP 專業分析系統
Sequence Alignment:雙序列比對
Six Frame:顯示 ORF 閱讀框架
Tandem Repeat:串聯重複序列查找
TF binding region:轉錄因子結合位分析
3D Mol* AR:分子結構擴增實境
3D Viewer (Mol*):3D 結構展示
Epitope prediction:抗原位分析
Fasta format:序列格式轉換
Functional Domain:功能區分析
Hydrophobicity:疏水性分析(穿膜區分析)
Multiple sequence alignment:多序列比對視覺化工具
M.W. analysis:計算蛋白質分子量等電點
Path Ontology:代謝途徑與功能分類分析儀表板
Pattern search:搜尋特定序列並計算出現頻率
Property Mapper:蛋白質特性視覺化工具
ProtParam:蛋白質生化特性
Random sequence:隨機生成序列
Secondary structure:蛋白質二級結構
Sequence Alignment:雙序列比對
Signal Peptide:訊息胜肽分析
Structure Prediction:Alpha Fold 指引
Data Preprocessing:數據前處理與品質檢驗工具
Likert Analysis:Likert量表系統性分析平台
IRR analysis:IRR 評分者間信度分析
Logistic Regression:臨床數據統計分析系統
Odds Adjusted:勝算比校正計算與分析
ROC curve:ROC曲線二分類模型效能評估
Significant test:顯著性檢定
Statistics Wizard:統計決策精靈
Stats Pro:統計分析工具 (進階版)
Stats tools:統計分析工具
Survival analysis:生存分析工具
HWE Analysis:哈溫平衡計算器
Odds Ratio:勝算比 (OR) 計算器
Scientific Calculator:科學計算器
TCID50 calculator:TCID50 計算器
Mol AR:分子結構擴增實境