Os laboratórios universitários e os grupos de estudos e/ou pesquisa desempenham um papel crucial no ambiente acadêmico e na sociedade como um todo. Eles oferecem oportunidades valiosas de aprendizado, pesquisa e inovação. Esses grupos permitem que os alunos desenvolvam habilidades práticas relevantes para suas áreas de estudo, como técnicas de pesquisa, análise de dados, operação de equipamentos e metodologias experimentais. Frequentemente promovem colaboração entre estudantes, professores, pesquisadores e até mesmo a comunidade externa.
O Laboratório de Estudos Medievais aqui da Universidade Federal da Fronteira Sul - campus Chapecó, privilegia o trabalho em redes de pesquisa, o que coloca os estudantes membros do Laboratório em estreito contato com os pesquisadores de outros núcleos do LEME e outras instituições de ensino e pesquisa, dentro e fora do Brasil. O Laboratório busca favorecer o acesso a documentos para pesquisa histórica na área de História Medieval, o contato com publicações atualizadas e clássicas desta área de pesquisa, além de organizar e incentivar a participação de seus membros em eventos e publicações temática.
O Núcleo de Estudos Afro-Brasileiros e Indígenas tem como objetivo a realização de atividades de ensino, pesquisa e extensão no campo das relações étnico-raciais, com foco especial nas populações africanas, afrodescendentes e indígenas. A existência dos NEABIs se soma a um conjunto de práticas, ações e políticas que visa conferir visibilidade para temáticas e grupos historicamente marginalizados dos espaços de poder e dos espaços de produção de conhecimento como sujeitos: população negra e indígena, suas histórias, culturas e identidades
Criado a partir de um grupo de estudos envolvendo estudantes da graduação e da pós-graduação, o Fronteiras: Laboratório de História Ambiental atua desde 2016, abrangendo os cursos de História e Geografia da Universidade Federal da Fronteira Sul. O laboratório tem como objetivo fomentar o desenvolvimento de pesquisas através do aporte teórico da História Ambiental. Assim como, se compromete a integrar pesquisadores num espaço interdisciplinar, institucional, propiciando debates e diálogos convergentes com as temáticas e estudos sobre o meio ambiente
O Laboratório Universitário de Patrimônio e Arqueologia surgiu em 2013 com o objetivo de fomentar atividades de ensino, pesquisa e extensão da instituição, nas áreas de Patrimônio Cultural, Arqueologia e Cultura Material, em relação interdisciplinar com outras áreas das Humanidades, como a História, Ciências Sociais, Geografia, etc. A extensão é realizada por meio de projetos que conectem a sociedade em geral com a universidade, sendo realizado ao longo dos anos atividades, cursos, oficinas e projetos de extensão institucionalizados. Conta em seu acervo com objetos que vão do período pré-colonial até o contemporâneo.
O Grupo de Pesquisa em Educação, Violência e Democracia tem por objetivo desenvolver pesquisas no campo Educação que envolvam as seguintes temáticas: democracia, violências, relações étnico-raciais, formação de professores, diálogo, hospitalidade e alteridade em diferentes cenários sociais, políticos e educacionais. Promover discussões teóricas sobre temas relacionados ao convívio democrático e aos desafios da educação nas democracias contemporâneas.