เดิมชื่อโรงเรียนบ้านเขาฉลาด เป็นโรงเรียนสังกัดสำนักงานการประถมศึกษาจังหวัดตราด เปิดทำการสอนเมื่อปี พ.ศ.๒๕๑๕ และในปี พ.ศ.๒๕๓๗ มีนักเรียนเข้าเรียนจำนวนน้อยไม่เพียงพอที่จะทำการสอนได้ จึงได้ให้นักเรียน จำนวน ๑๖ คน เดินทางไปเรียนที่โรงเรียนบ้านเจียรพัฒนา ซึ่งอยู่ห่างโรงเรียนบ้านเขาฉลาด ระยะทาง ๕ กิโลเมตร ซึ่งนักเรียนส่วนใหญ่ประสบความเดือดร้อนต้องเดินทางไกล และเสียค่ายานพาหนะในการเดินทาง
ต่อมาคณะกรรมการบริหารส่วนตำบลเทพนิมิต และคณะกรรมการบริหารหมู่บ้านเขาฉลาด ได้ทำหนังสือทูลเกล้าแจ้งถวายฎีกาไปยังกองราชเลขานุการในพระองค์ สมเด็จพระนางเจ้าฯ พระบรมราชินีนาถ เมื่อวันที่ ๒๒ มิถุนายน ๒๕๔๑
จึงได้มอบหมายให้ กองบัญชาการตำรวจตระเวนชายแดน โดย กองกำกับการตำรวจตระเวนชายแดนที่ ๑๑ เข้าไปดำเนินการพิจารณาช่วยเหลือประชาชน โดยได้สำรวจเด็กนักเรียนที่พร้อมจะเข้าเรียนในปีการศึกษา ๒๕๔๒ จำนวน ๕๐ คน จึงได้ประสานกับสำนักงานการประถมศึกษาจังหวัดตราด ขอใช้อาคารเรียนของโรงเรียนบ้านเขาฉลาด เพื่อจัดการเรียนการสอนให้กับนักเรียนที่ประสบปัญหาความเดือดร้อน และจัดส่งข้าราชการตำรวจตระเวนชายแดนจำนวน ๗ นาย ไปทำหน้าที่ครูผู้สอน โดย กองบัญชาการตำรวจตระเวนชายแดน อนุมัติให้เข้าทำการสอนอย่างเป็นทางการ เมื่อวันที่ ๑๗ พฤษภาคม พ.ศ.๒๕๔๒ โดยเป็นศูนย์การเรียนสาขาโรงเรียนตำรวจตระเวนชายแดนบ้านท่ากุ่ม และเปลี่ยนเป็นโรงเรียนตำรวจตระเวนชายแดนบ้านเขาฉลาด ในเวลาต่อมา
สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา ฯ สยามบรมราชกุมารี เสด็จพระราชดำเนินไปทรงติดตามผลการดำเนินงานโครงการตามพระราชดำริ และทรงเยี่ยมราษฎร จำนวน ๔ ครั้ง ดังนี้
ครั้งที่ ๑ วันที่ ๒๔ กรกฎาคม ๒๕๔๓
ครั้งที่ ๒ วันที่ ๒๕ พฤษภาคม ๒๕๔๙
ครั้งที่ ๓ วันที่ ๑๙ มิถุนายน ๒๕๕๑
ครั้งที่ ๔ วันที่ ๒๓ พฤษภาคม ๒๕๕๖
ครั้งที่ ๕ วันที่ ๒๙ มกราคม ๒๕๖๑