Родился в г. Одессе (Украина).

В начале Революции 1905 г. организовал в Севастополе «Союз офицеров — друзей народа», в который входил лишь сам Шмидт. Участвовал в создании «Одесского общества взаимопомощи моряков торгового флота». Ведя пропаганду среди матросов и офицеров, Шмидт называл себя внепартийным социалистом. Имел связи с «Бундом», и с неустановленными тайными политическими организациями Одессы, выступал за автономию Юга от Российской Империи с созданием президентской республики под своим руководством.

14 ноября 1905 г. П. П. Шмидт возглавил мятеж на крейсере «Очаков» и других судах Черноморского флота. Шмидт объявил себя командующим Черноморским флотом, дав сигнал: «Командую флотом. Шмидт». В тот же день он отправил телеграмму Николаю II с требованием созыва Учредительного собрания и передачи власти. 

15 ноября на «Очакове» был поднят красный флаг. Против восставшего крейсера правительство немедленно начало военные действия. В 3 часа дня начался морской бой, а в 4 часа 45 мин. царский флот уже одержал полную победу. Шмидт вместе с другими руководителями восстания был арестован.