Diretório Formativo

BG200 - Bioestatística

• Ministrada em todos os períodos

• Oferecida pelo Instituto de Biologia

• Ementa: “Conceitos básicos de probabilidade e estatística descritiva. Principais distribuições discretas e contínuas: Binomial, Hipergeométrica, Poisson, Normal, t, F, qui-quadrado. Amostragem. Estimação, teste de hipótese e intervalos de confiança para médias, proporções e variâncias. Regressão e correlação. Análise de variância. Utilização de tecnologia da informação e comunicação.“

BG870 - Introdução à Biologia Computacional

• Ministrada em períodos ímpares

• Oferecida pelo Instituto de Biologia

• Ementa: “Introdução a Biologia Computacional. Bancos de dados de informação biológica. Alinhamento de sequências. Identificação de motivos e domínios regulatórios. Predição gênica. Predição de estrutura de RNA e proteína. Reconstrução filogênética. Análise genômica e genômica comparativa. Metagenômica. Análise de expressão gênica. Redes de regulação gênica e redes metabólicas. Introdução a Biologia de Sistemas."

MC102 - Algoritmos e Programação de Computadores

• Ministrada em períodos pares

• Oferecida pelo Instituto de Computação

• Ementa: "Conceitos básicos de organização de computadores. Construção de algoritmos e sua representação em pseudocódigo e linguagens de alto nível. Desenvolvimento sistemático e implementação de programas. Estruturação, depuração, testes e documentação de programas. Resolução de problemas."

MC202 - Estruturas de Dados

• Ministrada em períodos pares

• Oferecida pelo Instituto de Computação

• Ementa: "Estruturas básicas para representação de informações: listas, árvores, grafos e suas generalizações. Algoritmos para construção, consulta e manipulação de tais estruturas. Desenvolvimento, implementação e testes de programas usando tais estruturas em aplicações específicas."

NG110 - Métodos Computacionais em Bioinformática

• Ministrada em períodos ímpares

• Oferecida pelo Instituto de Biologia

• Último documento de oferecimento da disciplina - Primeiro semestre de 2020

• Ementa: "Alinhamento, Montagem de genomas, Bancos de Dados e Buscas em Bancos de Dados, Transcriptoma, Introdução a Biologia de Sistemas, Análise Metagenômica e Metatranscriptômica, Filogenia Molecular e Filogenômica, Bioinformática Estrutural."

NG282 - Análise de Dados Biológicos em R

• Ministrada em períodos pares

• Oferecida pelo Instituto de Biologia

• Ementa: "A disciplina abordará conceitos básicos e avançados em análise de dados utilizando a Linguagem R. Ela é destinada principalmente a alunos que tenham a intenção de analisar dados qualitativos e quantitativos como ferramenta de estudo em seus projetos de pesquisa, mesmo aqueles que não tenham conhecimento em programação. Ao final dessa disciplina, esperamos que o aluno seja capaz de analisar seus próprios dados, aplicando testes estatísticos, produzindo gráficos simples e complexos, aplicando análises de classificação e produzindo relatórios de dados. Os temas a serem abordados serão: Lógica Computacional, R básico, Estatística básica, Dataframes e arquivos, Manipulações de datasets, Limpeza de dado, Funções, Dplyr e Tidyverse, Ggplot, Teste t, ANOVA, Testes não paramétricos, Teste qui-quadrado, Regressões lineares, Principal Component Analysis (PCA), Heatmaps, Clustering – Parte 1, Clustering – Parte 2,Árvore de decisão, Curvas ROC, Árvore de regressão, Mapas, Distribuição hipergeométrica e ajuste de p-values, Relatório de dados, Análises de genética populacional."

NG110 - Bioinformática Aplicada à Biotecnologia

• Ministrada em períodos ímpares

• Oferecida pelo Instituto de Biologia

• Ementa: "A disciplina tem como objetivo ampliar o escopo de análises de bioinformática com o foco em aplicações biotecnológicas. O curso terá aulas teóricas e práticas (ambiente linux) englobando análises de (meta)genômica, (meta)transcriptômica, metabolômica e integração entre ômicas num contexto de biologia de sistemas. Serão trabalhados dados in silico que envolvem desenvolvimento de leveduras industriais evoluídas e/ou geneticamente modificadas, análises de contaminações e perfis transcricionais em fermentações industriais e mineração em bancos de dados biológicos na identificação de novas enzimas e vias metabólicas."

NG264 - Princípios da Biologia de Sistemas

• Ministrada em períodos ímpares

• Oferecida pelo Instituto de Biologia

• Ementa: "Nesta disciplina serão discutidos diversos trabalhos científicos em biologia quantitativa, visando assim se aprofundar na interface entre biologia e ciências quantitativas. No decorrer da disciplina serão abordados temas como: dinâmica de redes para explicar propriedades de redes moleculares complexas; modelos qualitativos e quantitativos preditivos, desenho experimental e seus aspectos, avaliação e comparação de modelos; e estimativas de parâmetros. A partir deste conteúdo espera-se fornecer aos estudantes os princípios que formam o arcabouço necessário para a análise de redes moleculares in vivo. Permitindo assim que os estudantes possam: (a) formular experimentos que aperfeiçoem a aquisição de dados ricos em informação; (b) determinar os parâmetros das redes obtidas pelos dados experimentais; e (c) diferenciar, com base nos dados obtidos, os modelos plausíveis."

NG302 - Biologia Sistêmica e Integrativa Aplicada à Análise de Dados Moleculares

• Ministrada em períodos pares

• Oferecida pelo Instituto de Biologia 

• Último oferecimento em 2022

• Ementa: "Esta disciplina visa apresentar aos estudantes abordagens práticas de Biologia Computacional e Bioinformática capacitando-os para análise qualitativa dos arquivos de sequenciamentos, proposição de montagens de transcritos de novo ou baseada em modelos genômicos disponíveis, avaliação da expressão diferencial de genes/contigs entre situações diversas e anotação funcional dos transcritos envolvidos na análise. Adicionalmente, capacitar ou atualizar os alunos na utilização de ferramentas disponíveis no sistema operacional GNU/LINUX para a execução de todas as metodologias apresentadas durante o curso."