La acupuntura puede influir en el equilibrio entre el sistema nervioso simpático (asociado a la respuesta de "lucha o huida") y el parasimpático (asociado al descanso y la digestión). Esto puede llevar a una reducción del estrés, la ansiedad y la tensión muscular.

Estudios de neuroimagen han mostrado que la acupuntura puede modular la actividad en diversas áreas del cerebro involucradas en el procesamiento del dolor, las emociones y el estrés. Se ha observado una desactivación de áreas límbicas (relacionadas con las emociones) y de la red neuronal por defecto (activa cuando la mente está en reposo), lo que podría contribuir a sus efectos terapéuticos.