Den grønne omstilling har høj prioritet for Frederiksborg Gymnasium & HF. Det betyder, at bæredygtighed er et pædagogisk og strategisk fokusområde for skolen.
Projektet om bæredygtighed startede i 2019 og er i dag et permanent udvalg på skolen ved navn Det Grønne Råd. Udvalget har bred repræsentation fra ledelse, lærere (fra forskellige fakulteter), administration og elever.
Frederiksborg Gymnasium & HF er med i Grøn Skole og har modtaget det Grønne Flag.