遊戲共有三個不同種類的卡牌,分別為寶可夢(Pokémon)卡、能量(Energy)卡及訓練家(Trainer)卡。而一套牌中除了基本能量卡外,同樣名字的卡都不可放超過4張(菱形之星、光輝寶可夢只能放1張)。
一階進化卡寶可夢
基礎寶可夢
寶可夢卡為遊戲基本用卡,而寶可夢卡又分為基礎寶可夢及進化寶可夢。玩家在開局進行遊戲時只能使用基礎卡。遊戲時,每名玩家只可有一隻戰鬥寶可夢及5隻備戰寶可夢(某些寶可夢的特性可以增加備戰區寶可夢數量,如無極汰那Vmax)。
在卡牌的左上角有標示寶可夢的類型,分為基礎寶可夢、一階進化卡寶可夢、二階進化卡寶可夢。
以及現在主流的V卡、進化卡VMAX、VSTAR
V進化寶可夢
基礎V寶可夢
能量卡為寶可夢提供攻擊時所需的能量。能量卡分為基本能量卡及特殊能量卡兩種。當中基本能量分為十種:草(Grass)、火(Fire)、水(Water)、雷(Lightning)、超能力(Psychic)、格鬥(Fighting)、惡(Darkness)、鋼(Metal)、龍(Dragon)。惡與鋼的基本能量卡於「Diamond and Pearl」系列推出,在此之前只有特殊能量卡。龍的基本能量卡在Black & White的「龍之精選」卡包推出。妖精的基本能量卡則於XY才推出。另外,除十種基本能量卡外,遊戲另設有無色(Colorless)能量,任何一種能量都可以當作無色能量使用。最近又將一些能量取代
訓練家卡讓玩家可以進行更多支援工作,例如回復HP,將已送到棄牌堆的卡回到手牌或牌組等。訓練家卡(Trainer)分為支援者卡(Supporter)、物品卡(Item)、競技場卡(Stadium)。
相對於寶可夢主系列的十八種屬性,寶可夢集換式卡牌遊戲將其簡化到至十種屬性(包含無屬性)。當中惡(Evil)與鋼(Steel)為「Neo Genesis」系列加入的新屬性,以對應金銀版推出的寶可夢(但此時僅有特殊能量卡),龍(Dragon)屬性亦於之後推出,接著又新增了妖精(Fairy)屬性,以對應XY版本的寶可夢,接著妖精屬性在劍盾版本時與超能力屬性合併、而龍屬性亦在劍盾版本時與無屬性合併。
十一種屬性中只有九種有基本能量卡,其中不包含無色和龍屬性。