This Guidebook is a compilation and layout of photos of cryptic organisms collected using artificial reef structures called ARMS (Autonomous Reef Monitoring Structures) deployed at 5 NIPAS (National Integrated Protected Area Systems) sites in the Philippines. The sites are Palaui, Mabini (Verde Island Passage), Masinloc, Tubbataha, and Siargao. ARMS are passive, three-dimensional collectors developed by NOAA (National Oceanic and Atmospheric Administration, USA) which are meant to sample marine cryptofauna by mimicking the complexity of hard bottom marine substrates. ARMS attract both encrusting species such as corals and algae, and motile organisms such as crustaceans, mollusks, and polychaetes. ARMS provide a standardized and quantifiable biodiversity measure since marine communities are sampled over the same area and in the same exact manner over time. The abundance, composition, and diversity of organisms collected by ARMS are assessed through morphological and molecular analysis. This Guidebook contains the Field Guides of organisms collected by ARMS after a year of deployment at each of the 5 NIPAS sites. It also contains procedures for ARMS assembly, deployment, retrieval, and processing tailored to Philippine settings; and a guide to the scientific classification of organisms collected. The Guidebook is meant to serve stakeholders namely local government units, park managers, students, and researchers interested in monitoring diversity at the sites.

https://www.researchgate.net/publication/361923395_Guidebook_on_Coral_Reef_Associated_Organisms_Collected_from_Autonomous_Reef_Monitoring_Structures_ARMS_in_the_Philippines_-_A_Tool_for_Capacity_Building_in_Monitoring_Biodiversity_at_Selected_Reef_Sit 

Preface                                                                                                             1

What are ARMS?                                                                                              2

Purpose of ARMS                                                                                             2

ARMS Deployment Sites                                                                                  3

ARMS Philippines                                                                                             5

Materials for ARMS Unit Assembly                                                                  7

ARMS Deployment                                                                                          8

ARMS Retrieval                                                                                              10

ARMS Processing                                                                                          12

About the Field Guide                                                                                    20

Field Guide – Palaui, Cagayan                                                                       22

Phylum Annelida                                                                                   25

Phylum Mollusca                                                                                   28

Phylum Arthropoda Subphylum Crustacea                                          40

Phylum Echinodermata                                                                         48

Phylum Chordata Subphylum Vertebrata                                              55

Field Guide – Masinloc, Zambales                                                                58

Phylum Platyhelminthes                                                                        61

Phylum Annelida                                                                                   65

Phylum Mollusca                                                                                  69

Phylum Arthropoda Subphylum Crustacea                                          80

Phylum Echinodermata                                                                         87

Phylum Chordata Subphylum Vertebrata                                              91

Field Guide – Mabini, Batangas                                                                    94

Phylum Annelida                                                                                   97

Phylum Mollusca                                                                                 103

Phylum Arthropoda Subphylum Crustacea                                        120

Phylum Echinodermata                                                                       134

Phylum Chordata Subphylum Vertebrata                                            141

Field Guide – Tubbataha, Palawan                                                                94

Phylum Annelida                                                                                 147

Phylum Mollusca                                                                                 150

Phylum Arthropoda Subphylum Crustacea                                        160

Phylum Echinodermata                                                                       170

Phylum Chordata Subphylum Vertebrata                                            175

Field Guide – Siargao, Surigao del Norte                                                    178

Phylum Platyhelminthes                                                                      181

Phylum Annelida                                                                                 185

Phylum Mollusca                                                                                 188

Phylum Arthropoda Subphylum Crustacea                                        194

Phylum Echinodermata                                                                       201

Phylum Hemichordata                                                                        207

Phylum Chordata Subphylum Vertebrata                                           211

References                                                                                                  212

Final Note                                                                                                    220