池内研 新着情報

2017.4.16 東京大学生命科学ネットワーク発表
・陳泰駿、池内昌彦:代謝改変シアノバクテリアによるソルビトールの光合成生産 [ポスター賞受賞

・吉野宏明、奥田裕紀子、池内昌彦:従属栄養条件で培養可能な好熱性シアノバクテリア

2017年 研究室メンバー



2017.4.1
島田さん:修士課程入学

Kohzuma, K., Sato, Y., Ito, H., Okuzaki, A., Watanabe, M., Kobayashi, H., Nakano, M., Yamatani, H., Masuda, Y., Nagashima, Y., Fukuoka, H., Yamada, T., Kanazawa, A., Kitamura, K., Tabei, Y., Ikeuchi, M., Sakamoto, W., Tanaka, A., Kusaba, M. (2017) The non-Mendelian green cotyledon gene in soybean encodes a small subunit of Photosystem II. Plant Physiol. 173:2138-2147. [PubMed] 広島大・草場先生との共同研究です。

2017.1.31 学術支援職員・奥田さん退職
・5年間、大変お世話になりました。おかげさまで、研究は大きく進展しました。

2016.10 CREST研究開始(代表:佐藤守俊先生)

Takabayashi, A., Takabayashi, S., Takahashi, K., Watanabe, M., Uchida, H., Murakami, A., Fujita, T., Ikeuchi, M., Tanaka, A. (2017) PCoM-DB update: a protein co-migration database for photosynthetic organisms. Plant Cell Physiol. in press. [PubMed] 北大・高林先生、田中先生との共同研究です。

Fushimi K, Rockwell NC, Enomoto G, Ni-Ni-Win, Martin SS, Gan F, Bryant DA, Ikeuchi M, Lagarias JC, Narikawa R (2016) Cyanobacteriochrome photoreceptors lacking the canonical Cys residue. Biochemistry. 55: 6981-6995. [PubMed] 静岡大・成川先生との共同研究です。

Fushimi K, Nakajima T, Aono Y, Yamamoto T, Ni-Ni-Win, Ikeuchi M, Sato M, Narikawa R. (2016) Photoconversion and fluorescence properties of a red/green-type cyanobacteriochrome AM1_C0023g2 that binds not oznly phycocyanobilin but also biliverdin. Front Microbiol. 7:588. [PubMed] 静岡大・成川先生との共同研究です。

Noji, T., Suzuki, T., Kondo, M., Jin T., Kawakami, K., Mizuno, T., Oh-oka, H., Ikeuchi, M., Nango, M., Amao, Y., Kamiya, N., Dewa, T. (2016) Light-induced hydrogen production by photosystem I–Pt nanoparticle conjugates immobilized in porous glass plate nanopores. Res. Chem. Intermed. 42: 7731-7742. [ジャーナルサイト] 名古屋工業大学・出羽先生、野地さんとの共同研究です。

M. Tashiro, H. Kiyota, S. Kawai-Noma, K. Saito, M. Ikeuchi, Y. Iijima, D. Umeno (2016) Bacterial production of pinene by a laboratory-evolved pinene-synthase. Synthetic Biol. 16: 1011-20. [PubMed] 千葉大梅野先生との共同研究です。

2016年 研究室メンバー

2016.4.1 
榎本さん:助教に就任
松村さん:修士課程入学

2016.3.31 ポスドク・清田さん:就職、博士課程・榎本元さんの学位取得、卒研・松村さん:卒業、おめでとうございます。
榎本元さん:一高賞受賞

2016.2.29 論文採択、フランス、Falciatore博士との共同研究論文
Fortunato AE, Jaubert M, Enomoto G, Bouly JP, Raniello R, Thaler M, Malviya S, Bernardes JS, Rappaport F, Gentili B, Huysman MJ, Carbone A, Bowler C, d'Alcalà MR, Ikeuchi M, Falciatore A. (2016) Diatom phytochromes reveal the existence of far-red-light-based sensing in the ocean. Plant Cell, 28: 616-628. [PubMed]

2016.2.9 論文採択、長尾さん(現 名古屋大)の博士論文の一部です。
Nagao, R., Tomo, T., Narikawa, R., Enami, I., Ikeuchi, M. (2016) Conversion of photosystem II dimer to monomers during photoinhibition is tightly coupled with decrease in oxygen-evolving activity in the diatom Chaetoceros gracilis. Photosynth. Res. in press. [PubMed]

2015.9.21-26 International Conference Photosynthesis Research for Sustainability発表
Watanabe, M., Matsumura, M., Yoshino, H., Okuda, Y., Midorikawa, T., Ikeuchi, M., Photosystem I assembly compensates the photodamage of photosystem I

2015.9.5-7 日本植物学会発表
池内昌彦 シアノバクテリアの新規光受容体の発見と光合成関連機能の調節(受賞講演)

2015.9.3 成川さんの共同研究論文がBiochemistryに掲載されました。
Song C, Velazquez Escobar F, Xu XL, Narikawa R, Ikeuchi M, Siebert F, Gärtner W, Matysik J, Hildebrandt P. (2015) A red/green cyanobacteriochrome sustains its color despite a change in the bilin chromophore's protonation state. Biochemistry. 54: 5839-48. [PubMed]

2015.8.2-6 ISPP Tübingenポスター発表
K Maeda, Y Takase, R Narikawa, M Ikeuchi Identification and horizontal gene transfer of a novel cyanobacterial UDP-glucose pyrophosphate (CugP).
G Enomoto, R Narikawa, M Ikeuchi c-di-GMP mediates light-color dependent cell aggregation in Thermosynechococcus.

2015.6.26 成川さん共同研究論文がJ Phys Chem Bに掲載されました。
Song C, Narikawa R, Ikeuchi M, Gärtner W, Matysik J. (2015) Color tuning in red/green cyanobacteriochrome AnPixJ: photoisomerization at C15 causes an excited-state destabilization. J Phys Chem B. 119: 9688-95. [PubMed]

2015.6.16 論文オンライン発表・プレスリリース
Enomoto, G., Ni-Ni-Win, Narikawa, R., Ikeuchi, M. (2015) Three cyanobacteriochromes work together to form a light color-sensitive input system for c-di-GMP signaling of cell aggregation. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 112: 8082-8087.ジャーナルサイト][プレスリリース
3つの異なる光受容体(シアノバクテリオクロム)の役割分担を、1つのシアノバクテリアの細胞凝集とその誘因物質となる二次メッセンジャー分子c-di-GMPの合成・分解のレベルで解明しました。

2015.6.13
緑川貴文助教が病気のため、亡くなられました。痛恨の極みです。
緑川さんは東京薬科大学を卒業、東大理学系研究科修 了、博士(理学)の学位を取得後、カリフォルニア大学デービス校井上先生の研究室でポスドク、2014年4月より現職でした。研究は、植物の葉緑体とシア ノバクテリアでの光合成装置の形成機構を比較解析して、その制御と改変を目指すものでした。病気のため、32歳の若さで亡くなられました。謹んでご冥福を 祈ります。

2015.4.8 論文採択
Narikawa, R., Fushimi, K., Ni-Ni-Win, M. Ikeuchi (2015) Red-shifted red/green-type cyanobacteriochrome AM1_1870g3 from the chlorophyll d-bearing cyanobacterium Acaryochloris marina. Biochem. Biophys. Res. Comm. 461(2): 390-5. [PubMed

2015年メンバー 

2015.4入学 陳泰駿君 博士課程
2015.4卒研 松村雅子さん

2015.3.31 修了、卒業おめでとうございます
清田浩史君 博士課程
前田海成君 修士課程、一高賞
神谷綾子さん 修士課程
高瀬安迪君 卒業研究

論文発表
Maeda, K., Narikawa, R. and Ikeuchi, M. (2015) Measurement of nucleotide triphosphate sugar transferase activity via generation of pyrophosphate. Bio-Protocol, 5: e1450.

2015.3.26 農芸化学会にて発表
清田浩史、奥田裕紀子、平井優美、池内昌彦 イソプレノイド生産に向けたシアノバクテリアのGGPP (geranylgeranyl pyrophosphate) synthaseの酵素学的解析

2015.3.20論文採択
Hirose, Y., Katayama, M., Ohtsubo, Y., Misawa, N., Iioka, E., Suda, W., Ohsima, K., Hanaoka, M., Tanaka, K., Eki, T., Ikeuchi, M., Kikuchi, Y., Ishida, M., Hattori, M. (2015) Complete genome sequence of cyanobacterium Geminocystis sp. NIES-3709 that harbors phycoerythrin-rich phycobilisome. Genome Announcements, 3 (2): e00385-15. [PubMed] 広瀬さん(豊橋技科大)のゲノム解析論文。

2015.3.19論文採択
Hirose, Y., Katayama, M., Ohtsubo, Y., Misawa, N., Iioka, E., Suda, W., Ohsima, K., Hanaoka, M., Tanaka, K., Eki, T., Ikeuchi, M., Kikuchi, Y., Ishida, M., Hattori, M. (2015) Complete genome sequence of cyanobacterium Geminocystis sp. NIES-3708, which performs type II complementary chromatic acclimation. Genome Announcements, 3 (3): e00357-15. [PubMed] 広瀬さん(豊橋技科大)のゲノム解析論文。

2015.3.16-18 植物生理学会@東京農大にて発表
神谷綾子, 榎本元, 成川礼, 池内昌彦 好熱性シアノバクテリアにおけるサイクリックヌクレオチドシグナリング因子の解析
前田海成、成川礼、池内昌彦 シアノバクテリア特異的な新規UDP-グルコースピロホスホリラーゼCugPの生理的な機能と水平伝播
吉野宏明、井上康則、池内昌彦 フィロキノン分子数の異なる光化学系Iの解析.
榎本元, 成川礼, 池内昌彦 光波長高感度c-di-GMPシグナリングにおけるシアノバクテリオクロムの協調 
渡辺麻衣、DA Semchonok、EJ Boekema、池内昌彦 光化学系I特異的アンテナは窒素固定活性に重要である

2015.1.23 プレスリリース
Narikawa, R., Nakajima, T., Aono, Y., Fushimi, K., Enomoto, G., Ni-Ni-Win, Itho, S., Sato, M., Ikeuchi, M. (2015) A biliverdin-binding cyanobacteriochrome from the chlorophyll d–bearing cyanobacterium Acaryochloris marina. Scientific Reports, 5. [PubMed] [プレスリリース]

2014.9 論文発表
Kuroi, K., Okajima, K., Ikeuchi, M., Tokutomi, S. and Terazima, M. (2014) Transient conformational fluctuation of TePixD during a reaction. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. in press. [PubMed] 京大・寺嶋先生の光受容体の構造変化の解析の論文。

2014.9 論文発表
Midorikawa T, Endow JK, Dufour J, Zhu J, Inoue K (2014) Plastidic type I signal peptidase 1 is a redox-dependent thylakoidal processing peptidase. Plant J, in press. [ジャーナルサイト] 緑川さんのUC Davisでの2報目の論文。

2014.7.24 論文採択
Enomoto, G., Nomura, R., Shimada, T., Ni-Ni-Win, Narikawa, R., Ikeuchi, M. (2014) Cyanobacteriochrome SesA is a diguanylate cyclase that induces cell aggregation in Thermosynechococcus. J. Biol. Chem., in press. [PubMed] [フリーPDF] [東大ニュース]榎本君、野村君の論文がようやくまとまりました。本論文は、ジャーナルのpaper of the weekに選ばれました。

2014.7.19 ラン藻ゲノム交流会が駒場で開催されました。

2014.7.16 論文採択
Narikawa, R., Enomoto, G., Win, N.N., Fushimi, K. and Ikeuchi, M. (2014) A new type of dual-Cys cyanobacteriochrome GAF domain found in cyanobacterium Acaryochloris marina, which has an unusual red/blue reversible photoconversion cycle. Biochemistry, in press. [PubMed] アカリオクロリスのゲノムから、新しいタイプのCys残基依存性光変換を示すシアノバクテリオクロムを発見しました。

2014.6.30 論文採択
Osanai, T, Oikawa, A, Iijima, H, Kuwahara, A, Asayama, M, Tanaka, K, Ikeuchi, M, Saito, K, Hirai MY. (2014) Metabolomic analysis reveals rewiring of Synechocystis sp. PCC 6803 primary metabolism by ntcA-overexpression. Environ. Microbiol. in press. [PubMed]

2014.623 論文採択
Kiyota, H., Hirai, M.Y., Ikeuchi, M. (2014) NblA1/A2-dependent homeostasis of amino acid pools during nitrogen starvation in Synechocystis sp. PCC 6803. Metabolites, 4: 517-531. [PubMed] シアノバクテリアの窒素飢餓条件でのフィコビリソーム特異的な分解誘導の寄与をメタボローム的に評価しました。

2014.6.2〜7 国際会議「Photosynthesis Research for Sustainability-2014」ロシア
M. Ikeuchi: Engineering of antenna and photosystems in cyanobacteria.

2014.5.30〜31 発表 日本光合成学会@近畿大学
清田浩史、平井優美、池内昌彦、シアノバクテリアのイソプレノイド生産系の構築と改良
渡辺麻衣、奥田裕紀子、池内昌彦、クロロフィル合成強化による光化学系への影響
吉野宏明、井上康則、池内昌彦、好熱性シアノバクテリアにおけるmenD遺伝子破壊株の解析
前田海成、成川礼、池内昌彦、UDP-グルコースを合成するシアノバクテリア特有の新規酵素の同定と光合成を含む生理的な役割

2014.5.29 論文発表
K. Hori, F. Maruyama, T. Fujisawa, T. Togashi, N. Yamamoto, M. Seo, S. Sato, T. Yamada, H. Mori, N. Tajima, T. Moriyama, M. Ikeuchi, M. Watanabe, H. Wada, K. Kobayashi, M. Saito, T. Masuda, Y. Sasaki-Sekimoto, K. Mashiguchi, K. Awai, M. Shimojima, S. Masuda, M. Iwai, T. Nobusawa, T. N., S. Kondo, H. Saito, R. Sato, M. Murakawa, Y. Ihara, Y. Oshima-Yamada, K. Ohtaka, M. Satoh, K. Sonobe, M. Ishii, R. Ohtani, M. Kanamori-Sato, R. Honoki, D. Miyazaki, H. Mochizuki, J. Umetsu, K. Higashi, D. Shibata, Y. Kamiya, N. Sato, Y. Nakamura, S. Tabata, S. Ida, K. Kurokawa, and H. Ohta (2014) Klebsormidium flaccidum genome reveals primary factors for plant terrestrial adaptation. Nature Comm. 5: 3978. [PubMed] プレスリリース 藻類と陸上植物の中間的な存在である車軸藻植物門クレブソルミディウムのゲノムを解読し、藻類から陸上植物に至る遺伝子の進化過程を解明しました。東工大・太田先生らとのGCOE共同プロジェクトの成果です。

2014.5.27 論文採択
Kiyota, H., Okuda, Y., Ito, M., Hirai, M.Y., Ikeuchi, M. (2014) Engineering for photosynthetic limonene production by cyanobacteria from CO2. J. Biotechnol. 185: 1-7. [PubMed] シアノバクテリアに植物の酵素を導入して、揮発性イソプレノイドのリモネンの光合成による生産に成功しました。

2014.4.26 東京大学生命科学シンポジウム
前田海成、成川礼、池内昌彦、シアノバクテリア特有の新規UDP-グルコース合成酵素の同定、ポスター賞

2014年メンバー

2014.4.9卒業研究(7学期)
高瀬安迪君、平松正大君が加わりました。

2014.4.7論文採択
Maeda, K., Narikawa, R., Ikeuchi, M. (2014) CugP is a novel ubiquitous non-GalU-type bacterial UDP-glucose pyrophosphorylase found in cyanobacteria. J. Bacteriol., 196, 2348-2354. [PubMed]  シアノバクテリアに普遍的に存在する新規のUDPグルコース合成酵素を発見し、CugPと命名しました。

2014.4 入学:吉野宏明君・博士課程
2014.4 着任:緑川貴文・助教
2014.3 卒業:吉野宏明君・修士課程、広域科学専攻奨励賞
2014.3 成川礼助教→2014.4より、静岡大学講師
・Ni Ni Winさん:2年間ありがとうございました。

2014.3.27〜30 発表 日本農芸化学会、東京
清田浩史、平井優美、池内昌彦、代謝改変シアノバクテリアを用いたリモネンの光合成的生産

2014.3.18〜20 発表 日本植物生理学会、富山
渡辺麻衣、奥田裕紀子、池内昌彦、光化学系量比の改変による光合成活性への影響
榎本元、成川礼、池内昌彦、3つのシアノバクテリオクロム型光受容体がもつc-di-GMPシグナリングへの寄与
吉野宏明、井上康則、池内昌彦、Thermosynechococcus elongatus におけるフィロキノン生合成系遺伝子menD完全破壊株の作製と解析
前田海成、成川礼、池内昌彦、A novel type of UDP-glucose pyrophosphorylase (CugP) for all cyanobacteria.

2014.3.7〜9 発表 日本ゲノム微生物学会、東京
前田海成、成川礼、池内昌彦、新規UDP-glucose pyrophosphorylase (CugP)の同定と水平伝播、ポスター賞

2014.2.4 発表論文+プレスリリース追加
Watanabe, M., Semchonok, D.A., Webber-Birungi, M., Ehira, S., Kondo, K., Narikawa, R., Ohmori, M., Boekema, E.J. and Ikeuchi, M. (2014) Attachment of phycobilisomes in an antenna-photosystem I supercomplex of cyanobacteria. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. in press. [PubMed]   プレスリリース アナベナの光化学系Ⅰ複合体の4量体とフィコビリソームの超複合体を発見しました。Boekema教授との共同研究で、その超構造を解明しました。

2014.1 発表論文追加
Watanabe M., and Ikeuchi, M. (2013) Phycobilisome: architecture of a light-harvesting supercomplex. Photosynth. Res. 116: 265-276. [PubMed]  フィコビリソームの構築のレヴュー:ロッドの「スケルトンモデル」を比較検討しました。

Osanai T, Oikawa A, Shirai T, Kuwahara A, Iijima H, Tanaka K, Ikeuchi M, Kondo A, Saito K, Hirai MY. (2014) Capillary electrophoresis-mass spectrometry reveals the distribution of carbon metabolites during nitrogen starvation in Synechocystis sp. PCC 6803. Environ Microbiol. 16: 512-524. [PubMed] 

Escobar VF, Utesch T, Narikawa R, Ikeuchi M, Mroginski MA, Gärtner W, Hildebrandt P. (2013) Photoconversion mechanism of the second GAF domain of cyanobacteriochrome AnPixJ and the cofactor structure of its green-absorbing state. Biochemistry, 52: 4871-4880. [PubMed] 

Gottlieb S.M., Kim P.W., Rockwell N.C., Hirose Y., Ikeuchi M., Lagarias J.C., Larsen D.S. (2013) Primary photodynamics of the green/red-absorbing photoswitching regulator of the chromatic adaptation E domain from Fremyella diplosiphon. Biochemistry, 52: 8198-8208. [PubMed] 

Kuroi K, Tanaka K, Okajima K, Ikeuchi M, Tokutomi S, Terazima M. (2013) Anomalous diffusion of TePixD and identification of the photoreaction product. Photochem Photobiol Sci. 12:1180-6. [PubMed] 

Ohbayashi R, Watanabe S, Kanesaki Y, Narikawa R, Chibazakura T, Ikeuchi M, Yoshikawa H. (2013) DNA replication depends on photosynthetic electron transport in cyanobacteria. FEMS Microbiol Lett. 344: 138-44. [PubMed] 

Osanai T, Kuwahara A, Iijima H, Toyooka K, Sato M, Tanaka K, Ikeuchi M, Saito K, Hirai MY. (2013) Pleiotropic effect of sigE over-expression on cell morphology, photosynthesis and hydrogen production in Synechocystis sp. PCC 6803. Plant J. 76: 456-465. [PubMed] 

2013研究室メンバー

2013.4入学:神谷綾子さん、前田海成君・生命環境科学系修士課程
2013.3 卒業:前田海成君・生命・認知科学科

2013.3植物生理学会発表:成川礼、渡辺麻衣、清田浩史、榎本元、吉野宏明
2013.3ゲノム微生物学会発表:鈴木布美子

(2013.3追加)
R. Nagao, T. Tomo, R. Narikawa, I. Enami, M. Ikeuchi (2013) Light-independent biosynthesis and assembly of the photosystem II complex in the diatom Chaetoceros gracilis. FEBS Lett. 587: 1340-1345. [PubMed]

Hirose, Y., Rockwell, N.C., Nishiyama, K., Narikawa, R., Ukaji, Y., Inomata, K., Lagarias, J.C., Ikeuchi, M. (2013) Green/red cyanobacteriochromes regulate complementary chromatic acclimation via a protochromic photocycle. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110: 4974-4979. [PubMed]プレスリリース


(2012.12追加)
Narikawa, R., Ishizuka, T., Muraki, N., Shiba, T., Kurisu, G. and Ikeuchi, M. (2013) Structures of cyanobacteriochromes from phototaxis regulators AnPixJ and TePixJ reveal general and specific photoconversion mechanism. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 110: 918-23. [PubMed]プレスリリース

Liauw P, Mashiba T, Kopczak M, Wiegand K, Muraki N, Kubota H, Kawano Y, Ikeuchi M, Hase T, Rögner M, Kurisu G. (2012) Cloning, expression, crystallization and preliminary X-ray studies of the ferredoxin-NAD(P)+ reductase from the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus BP-1. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 68:1048-51. [PubMed]

Tanaka K, Nakasone Y, Okajima K, Ikeuchi M, Tokutomi S, Terazima M. (2012) Time-resolved tracking of interprotein signal transduction: Synechocystis PixD-PixE complex as a sensor of light intensity. J Am Chem Soc. 134: 8336-9. [PubMed]

R. Nagao, T. Tomo, E. Noguchi, T. Suzuki, A. Okumura, R. Narikawa, I. Enami and M. Ikeuchi (2012) Proteases are associated with a minor fucoxanthin chlorophyll a/c-binding protein from the diatom, Chaetoceros gracilis. Biochim. Biophys. Acta 1817: 2110-2117. [PubMed]

Yoshimura H, Ikeuchi M, Ohomori M. (2012) Cell surface-associated proteins in the filamentous cyanobacterium Anabaena sp. strain PCC 7120. Microbes Environ. 27: 538-43. [PubMed]

Nowaczyk MM, Krause K, Mieseler M, Sczibilanski A, Ikeuchi M, Rögner M. (2012) Deletion of psbJ leads to accumulation of Psb27-Psb28 photosystem II complexes in Thermosynechococcus elongatus. Biochim Biophys Acta. 1817: 1339-45. [PubMed]


2012.5.14 Ni Ni Winさん(学術支援職員)が加わりました。

2012.4.9集合写真

2012.4.1入学:吉野宏明くん・修士課程。卒業研究:前田海成くん・生命・認知科学科。CREST特任研究員:渡辺麻衣さん。

2012.3.31 卒業:渡辺麻衣さん・博士課程、長尾遼くん・博士課程、田村洵也くん・修士課程、吉野宏明くん・生命・認知科学科。卒業おめでとうございます。

Enomoto, G., Hirose, Y., Narikawa, R., and Ikeuchi, M. (2012) Thiol-based photocycle of the blue and teal light–sensing cyanobacteriochrome Tlr1999. Biochemistry, 51: 3050-3058. [PubMed]

Kanesaki, Y., Shiwa, Y., Tajima, N., Suzuki, M., Watanabe, S., Sato, N., Ikeuchi, M., and Yoshikawa, H. (2012) Identification of substrain-specific mutations by massively parallel whole-genome resequencing of Synechocystis sp. PCC 6803. DNA Res. 19: 67-79. [PubMed]

2012.2.1より、奥田裕紀子さん(学術支援職員)が加わりました。

2011.12.1よりCREST研究「構造と進化の理解に基づく光合成の環境適応能力の強化」(代表:鹿内利治・京都大)を開始しました。当研究室は、「シアノバクテリアの光化学系機能の強化」という課題で、本研究を推進します。

Watanabe, M., Sato, M., Kondo, K., Narikawa, R. and Ikeuchi, M. (2012) Phycobilisome model with novel skeleton-like structures in a glaucocystophyte Cyanophora paradoxa. Biochim. Biophys. Acta 1817: 1428-1435. [Elsevier]

Midorikawa, T., Narikawa, R., and Ikeuchi, M. (2012) A deletion mutation in the spacing within the psaA core promoter enhances transcription in a cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. Plant Cell Physiol. 53: 164-172. [PubMed]

Narikawa, R., Suzuki, F., Yoshihara, S., Higashi, S., Watanabe, M. and Ikeuchi, M. (2011) Novel photosensory two-component system (PixA-NixB-NixC) involved in the regulation of positive and negative phototaxis of cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. Plant Cell Physiol. 52: 2214-2224. [PubMed]

Noji, T. Suzuki., H., Gotoh, T., Iwai, M., Ikeuchi, M., Tomo, T. and Noguchi, T. (2011) Photosystem II gold nanoparticle conjugate as a nanodevice for the development of artificial light-driven water-splitting systems. J. Phys. Chem. Lett. 2: 2448–2452. [PubMed]

Fukushima Y, Iwaki M, Narikawa R, Ikeuchi M, Tomita Y, Itoh S. (2011) Photoconversion mechanism of a green/red photosensory cyanobacteriochrome AnPixJ: time-resolved optical spectroscopy and FTIR analysis of the AnPixJ-GAF2 domain. Biochemistry 50: 6328-39. [PubMed]

2011.4.1〜21 HPの各ページを徐々に更新しています。また、古いトップページからこの新着ページに来た方は、上の新HPにアクセス下さい。この最新のページでは、Arthrospiraの走査電顕の写真などもアップしています。
バイオテクノロジーのページを更新

2011.7研究室バーベキュー大会@駒場野公園


2011.7学位取得:河野祐介、博士(学術)→信州大・博士研究員

2011(追加)
Tajima, N., Sato, S., Maruyama, F., Kaneko, T., Sasaki, N.V., Kurokawa, K., Ohta, H., Kanesaki, Y., Yoshikawa, H., Tabata, S., Ikeuchi, M., and Sato, N. (2011) Genomic structure of the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 strain GT-S. DNA Res. 18: 393-9. [PubMed]

Tanaka K, Nakasone Y, Okajima K, Ikeuchi M, Tokutomi S, Terazima M. (2011) A way to sense light intensity: Multiple-excitation of the BLUF photoreceptor TePixD suppresses conformational change. FEBS Lett. 585: 786-90. [PubMed]

Tanaka K, Nakasone Y, Okajima K, Ikeuchi M, Tokutomi S, Terazima M. (2011) Light-induced conformational change and transient dissociation reaction of the BLUF photoreceptor Synechocystis PixD (Slr1694). J Mol Biol. 409: 773-85. [PubMed]

Osanai, T., Oikawa, A., Azuma, M., Tanaka, K., Saito, K., Hirai, M.Y., and Ikeuchi, M. (2011) Genetic engineering of the group 2 sigma factor SigE widely activates the expressions of sugar catabolic genes in Synechocystis sp. PCC 6803. J Biol Chem. 286: 30962-71. [PubMed]

2011.4集合写真

2011.4.1新メンバー
鈴木布美子 D1
清田浩史 D1
榎本元 M1
吉野宏明 卒研

2011.3学位取得
広瀬侑、博士(理学)→学振研究員(東大服部研)
緑川貴文、博士(理学)→博士研究員(UC Davis, Inoue lab)
清田浩史、修士(理学)
田中麻貴、修士(理学)
浜田庄二郎、修士(学術)

2011年
Yoshimura, H., Kotake, T., Aohara, T., Tsumuraya, Y., Ikeuchi, M. and Ohmori, M. The role of extracellular polysaccharides produced by the terrestrial cyanobacterium Nostoc sp. strain HK-01 in NaCl tolerance. J. Appl. Phycol. 24: 237-243, 2012. [SpringerLink]

Kawano, Y., Saotome, T., Ochiai, Y., Katayama, M., Narikawa, R. and Ikeuchi, M. Cellulose accumulation and a cellulose synthase gene are responsible for cell aggregation in the cyanobacterium Thermosynechococcus vulcanus RKN. Plant Cell Physiol. 52: 957-66. [PubMed]

Toyooka T, Tanaka K, Okajima K, Ikeuchi M, Tokutomi S, and Terazima M. Macromolecular crowding effects on reactions of TePixD (Tll0078). Photochem Photobiol. 87: 584-9. [PubMed]

Kawakami, K., Umena, Y., Iwai, M., Kawabata, Y., Ikeuchi, M., Kamiya, N. and Shen, J.-R. (2011) Roles of PsbI and PsbM in photosystem II dimer formation and stability studied by deletion mutagenesis and X-ray crystallography. Biochim. Biophys. Acta, 1807: 319-325. [PubMed]

Ishizuka, T., Kamiya, A., Suzuki, H., Narikawa, R., Noguchi, T., Kohchi, T., Inomata, K., and Ikeuchi, M. (2011) The cyanobacteriochrome, TePixJ, isomerizes its own chromophore by converting phycocyanobilin to phycoviolobilin. Biochemistry, 50: 953-961. [PubMed]

Watanabe, M., Kubota, H., Wada, H., Narikawa, R. and Ikeuchi, M. (2011) Novel supercomplex organization of Photosystem I in Anabaena and Cyanophora paradoxa. Plant Cell Physiol. 52: 162-168. [PubMed]


2010年
Yoshimura, H., Kaneko, Y., Ehira, S., Yoshihara, S., Ikeuchi, M. and Ohmori, M. (2010) CccS and CccP are involved in construction of cell surface components in the cyanobacterium Synechocystis sp. strain PCC 6803. Plant Cell Physiol. 51: 1163-72. [PubMed]

Nagao, R., Suzuki, T., Okumura, A., Niikura, A., Iwai, M., Dohmae, N., Tomo, T., Shen, J.R., Ikeuchi, M. and Enami, I. (2010) Topological analysis of the extrinsic PsbO, PsbP and PsbQ proteins in a green algal Photosystem II complex by crosslinking with a water-soluble carbodiimide. Plant Cell Physiol. 51: 718-727. [PubMed]

Hirose, Y., Narikawa, R., Katayama, M. and Ikeuchi, M. (2010) Cyanobacteriochrome CcaS regulates phycoerythrin accumulation in Nostoc punctiforme, a group II chromatic adapter. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 8854-8859. [PubMed]

2010/04/13 駒場キャンパスにて
(後列: M2 濱田、B4 榎本(新)、D3 緑川、D3 河野
中列: D3 早乙女、助教 成川、D3 渡辺、M1 田村(新)、M2 清田
前列: M2 田中、D3 広瀬、教授 池内、D2 長尾)

2010年(つづき)

2010.4.1新メンバー
田村洵也 M1
榎本 元 卒研
早乙女敏行 D3(復帰)

Fujisawa T, Narikawa R, Okamoto S, Ehira S, Yoshimura H, Suzuki I, Masuda T, Mochimaru M, Takaichi S, Awai K, Sekine M, Horikawa H, Yashiro I, Omata S, Takarada H, Katano Y, Kosugi H, Tanikawa S, Ohmori K, Sato N, Ikeuchi M, Fujita N, Ohmori M. Genomic structure of an economically important cyanobacterium, Arthrospira (Spirulina) platensis NIES-39. (2010) DNA Res. 17: 85-103. [PubMed]

Iwai M, Suzuki T, Kamiyama A, Sakurai I, Dohmae N, Inoue Y, Ikeuchi M. PsbK subunit is required for the stable assembly and stability of other small subunits in the Photosystem II complex in the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus BP-1. (2010) Plant Cell Physiol. 51: 554-560. [PubMed]

Takasaka K, Iwai M, Umena Y, Kawakami K, Ohmori Y, Ikeuchi M, Takahashi Y, Kamiya N, Shen JR. Structural and functional studies on Ycf12 (Psb30) and PsbZ-deletion mutants from a thermophilic cyanobacterium. (2010) Biochim Biophys Acta. 1797:278-84. [PubMed]

Nagao R, Tomo T, Noguchi E, Nakajima S, Suzuki T, Okumura A, Kashino Y, Mimuro M, Ikeuchi M, Enami I. Purification and characterization of a stable oxygen-evolving Photosystem II complex from a marine centric diatom, Chaetoceros gracilis. (2010) Biochim Biophys Acta. 1797:160-6. [PubMed]

Allakhverdiev, S.I., Tomo, T., Shimada, Y., Kindo, H., Nagao, R., Klimov, V.V., and Mimuro, M. (2010) Redox potential of pheophytin a in photosystem II of two cyanobacteria having the different special pair chlorophylls. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 107: 3924-3929. [PubMed]

Shibamoto, T., Kato, Y., Nagao, R., Yamazaki, T., Tomo, T., Watanabe, T. (2010) Species-dependence of the redox potential of the primary quinone electron acceptor QA in photosystem II verified by spectroelectrochemistry. FEBS Lett. 584: 1526-30. [PubMed]

2009年

2009.4.1新メンバー
長尾 遼 D1
清田浩史 M1
田中麻貴 M1
浜田庄二郎 M1
 

Cormann KU, Ikeuchi M, Rogner M, Nowaczyk MM, Stoll R. Sequence-specific (1)H, (13)C, and (15)N backbone assignment of Psb27 from Synechocystis PCC 6803. (2009) Biomol NMR Assign.3:247-9. [PubMed]

Cormann KU, Bangert JA, Ikeuchi M, Rogner M, Stoll R, Nowaczyk MM. Structure of Psb27 in solution: implications for transient binding to photosystem II during biogenesis and repair. (2009) Biochemistry. 48: 8768-70. [PubMed]

Midorikawa T, Matsumoto K, Narikawa R, Ikeuchi M. An Rrf2-Type Transcriptional Regulator Is Required for Expression of psaAB Genes in the Cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. (2009) Plant Physiol. 151: 882-92. [PubMed]

Watanabe M, Iwai M, Narikawa R, Ikeuchi M. Is the photosystem II complex a monomer or a dimer? (2009) Plant Cell Physiol. 50: 1674-80. [PubMed]

Tanaka K, Nakasone Y, Okajima K, Ikeuchi M, Tokutomi S, Terazima M. Oligomeric-state-dependent conformational change of the BLUF protein TePixD (Tll0078). (2009) J Mol Biol. 386: 1290-300. [PubMed]

Shibata Y, Murai Y, Satoh Y, Fukushima Y, Okajima K, Ikeuchi M, Itoh S. Acceleration of electron-transfer-induced fluorescence quenching upon conversion to the signaling state in the blue-light receptor, TePixD, from Thermosynechococcus elongatus. (2009) J Phys Chem B. 113: 8192-8. [PubMed]

Osanai T, Imashimizu M, Seki A, Sato S, Tabata S, Imamura S, Asayama M, Ikeuchi M, Tanaka K. ChlH, the H subunit of the Mg-chelatase, is an anti-sigma factor for SigE in Synechocystis sp. PCC 6803. (2009) Proc Natl Acad Sci U S A. 106: 6860-5. [PubMed]

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2008年

2008.4.1新メンバー
渡辺麻衣 D1
野村怜平 M1

Kondo K, Mullineaux CW, Ikeuchi M. Distinct roles of CpcG1-phycobilisome and CpcG2-phycobilisome in state transitions in a cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. (2009) Photosynth Res. 99: 217-25. [PubMed]

Myouga F, Hosoda C, Umezawa T, Iizumi H, Kuromori T, Motohashi R, Shono Y, Nagata N, Ikeuchi M, Shinozaki K. A heterocomplex of iron superoxide dismutases defends chloroplast nucleoids against oxidative stress and is essential for chloroplast development in Arabidopsis. (2008) Plant Cell. 20: 3148-62. [PubMed]

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Hishiya S, Hatakeyama W, Mizota Y, Hosoya-Matsuda N, Motohashi K, Ikeuchi M, Hisabori T. (2008) Binary reducing equivalent pathways using NADPH-thioredoxin reductase and ferredoxin-thioredoxin reductase in the cyanobacterium Synechocystis sp. strain PCC 6803. Plant Cell Physiol. 49: 11-8. [PubMed]

2007年

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Takahashi, R., Okajima, K., Suzuki, H., Nakamura, H., Ikeuchi, M. and Noguchi, T. (2007) FTIR study on the hydrogen-bond structure of a key tyrosine residue in the flavin-binding blue light sensor TePixD from Thermosynechococcus elongatus. Biochemistry 46: 6459-6467.

Kondo, K., Ochiai, Y., Katayama, M. and Ikeuchi, M. (2007) The membrane-associated CpcG2-phycobilisome in Synechocystis; a new Photosystem I antenna. Plant Physiol. 144: 1200–10.

Ishizuka, T., Narikawa, R., Kohchi, T., Katayama, M. and Ikeuchi, M. (2007) Cyanobacteriochrome TePixJ of Thermosynechococcus elongatus harbors phycoviolobilin as a chromophore. Plant Cell Physiol. 48: 1385–1390. [PubMed]

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Iwai, M., Suzuki, T., Dohmae, N., Inoue, Y. and Ikeuchi, M. (2007) Absence of the PsbZ subunits prevents association of the PsbK and Ycf12 with the photosystem II in the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus BP-1. Plant Cell Physiol. 48: 1758–63.

Higo, A., Suzuki, T., Ikeuchi, M., and Ohmori, M. (2007) Dynamic transcriptional changes in response to rehydration in Anabaena sp. PCC 7120. Microbiology, 153: 3685-94.

2006年

Iwai, M., Katayama, M. and Ikeuchi, M. (2006) Absence of the psbH gene product destabilizes Photosystem II complex: the lack of PSII-X protein in the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus BP-1. Photosynth. Res. 87: 313-322.

Yoshimura, H., Ikeuchi, M. and Ohmori, M. (2006) Up-regulated gene expression during dehydration in terrestrial cyanobacterium Nostoc sp. HK-01. Microbe Environ. 21: 129-133.

Kobayashi, M., Katoh, H. and Ikeuchi, M. (2006) Mutations in a putative chloride efflux transporter gene suppress the chloride requirement of the photosystem II in psbV-disruptant (or cytochrome c550 deficient mutant). Plant Cell Physiol. 47: 799-804.

Higo, A., Katoh, H., Ohmori, K., Ikeuchi, M. and Ohmori, M. (2006) The role of a gene cluster for trehalose metabolism in dehydration tolerance of the filamentous cyanobacterium Anabaena sp. PCC 7120. Microbiology 152: 979-987.

Ishizuka, T., Shimada, T., Okajima, K., Yoshihara, S., Ochiai, Y., Katayama, M. and Ikeuchi, M. (2006) Characterization of cyanobacteriochrome TePixJ from a thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus strain BP-1. Plant Cell Physiol. 47: 1251-1261.

Okajima, K., Fukushima, Y., Suzuki, H., Kita, A., Ochiai, Y., Katayama, M., Shibata, Y., Miki, K., Noguchi, T., Itoh, S. and Ikeuchi, M. (2006) Fate determination of the flavin photoreceptions in the cyanobacterial blue light receptor TePixD (Tll0078). J. Mol. Biol. 363: 10-18.

Seki, A., Nakano, T., Takahashi, H., Matsumoto, K., Ikeuchi, M., and Tanaka, K. (2006) Light-responsive transcriptional regulation of the suf promoters involved in Fe-S cluster biogenesis in a cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. FEBS Lett. 580: 5044-5048.

Narikawa, R., Zikihara, K., Okajima, K., Ochiai, Y., Katayama, M., Shichida, Y., Tokutomi, S. and Ikeuchi, M. (2006) Three putative photosensory flavin-PAS domains with distinct biochemical properties from the filamentous cyanobacterium Anabaena sp. PCC 7120. Photochem. Photobiol. 82: 1627–33.