第3回研究会

第3回研究会

• 開催日：2019年8月29日(木) 10:00 ~ 17:40
• 場所：東京大学 理学部2号館 講義室223号室
• 発表形式：
  • ロングトーク 15分 （発表12分 質疑3分）
  • ショートトーク 3分 (発表のみ)

研究会の参加に関するお問い合わせ、ご相談等はページ下部記載の連絡先までご連絡ください。

お知らせ

• 当日は、本研究会にご協賛頂いている３社によるスポンサードセミナーを開催することとなりました。

・12:00~12:35 タカラバイオ株式会社によるランチョンセミナー（お弁当：参加登録順 先着70名）

・14:45~14:58 株式会社ヒューマノーム研究所よるライトニングセミナー

・16:10~16:23 JSR株式会社によるライトニングセミナー

（19/8/22更新）

• プログラムを決定しました。（19/8/22更新）

参加登録

発表申込は8月20日に締め切りました。たくさんのお申込みをいただきありがとうございました。

なお、聴講でのご参加は現在も受け付けております。

プログラム

10:00 ~ 10:05 挨拶

10:05 ~ 10:53 ロングトーク（3名）

慶應大 榊原・佐藤研

• 和田かおる 「ナノポアシーケンサーを用いたカニクイザル腸内細菌叢のメタゲノム解析」

東工大 石田研

• 多治見隆志 「分子特徴ベクトルと学習アルゴリズムのアンサンブルによるリガンドべース活性予測精度の向上」
• 佐藤倫 「グラフ畳み込み深層学習による予測立体構造評価手法の開発」

11:10 ~ 11:44 ショートトーク（前半・11名）

東大 岩崎研

• 西口智也「MOCCS2を用いた多様な転写因子のDNA結合配列の列挙」
• 松下翔真 「環境DNA解析に対する環境RNA解析の優位性」
• 占部雄飛 「様々な致死ストレス環境における微生物のゲノムレベルでの反応を捉える」
• 小林桃佳 「異質倍数化に伴う菌類の生活環の変化」

早大 浜田研

• 細田至温
• 望月万里名 「FICを用いたメタゲノムのビニング」
• 関根光太郎 「転移因子由来遺伝子調節領域に基づくニューロンサブタイプの再検討」
• 鈴木ゆりあ 「二次構造を考慮したCRISPR/Cas13crRNAのデザインツール開発」
• 野崎安利紗 「エンハンサーRNAの特徴抽出による機能解明」
• 今津裕太 「Ab initioな反復配列の検出法による未知の反復配列の発見」
• 馬碩 「Prediction of interactions between long non coding RNA and chromatin 」

11:45 ~ 11:59 お弁当配布

12:00 ~ 12:35 ランチョンセミナー（発表30分・質疑5分）

タカラバイオ株式会社

北川正成 様 「タカラバイオにおけるバイオインフォマティクスの活用と人材の募集」

12:50 ~ 13:38 ロングトーク（3名）

東大 岩崎研

• 坂本侑紀 「科学論文における画像改竄チェックの自動化に向けて」
• 山内駿 「Large-scale analysis of "alternative reading frame" toward understanding how novel genes evolve（新規遺伝子の誕生メカニズム解明に向けた「ずれたリーディングフレーム」の大規模ゲノム進化解析）」
• 尾崎雄一朗 「ニホンメダカ種群の繁殖行動における系統差を定量する」

13:55 ~ 14:43 ロングトーク（3名）

早大 浜田研

• Yiqian Zhang 「Developing an efficient software for MeRIP-Seq signal detection」

早大 清水研

• 岩田大輝 「属性ベース暗号とIntel SGXを用いた生命情報秘匿分析プロトコル」
• 櫻井碧 「BioVM-SGX：生命情報解析向け仮想マシンを搭載したSGXクラウド」

14:45 ~ 14:58 ライトニングセミナー （発表10分・質疑3分）

株式会社ヒューマノーム研究所

庄司竜麻 様 「Humanome Lab のご紹介」

15:20 ~ 16:08 ロングトーク（3名）

慶應大 榊原・佐藤研

• 瀬戸卓弥 「深層学習を用いた食道癌CT画像の分類」
• 秋山真那斗 「A max-margin training of RNA secondary structure prediction integrated with the thermodynamic model」

東大 大学院 新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻

• 鈴木創 「高速なseed-and-extendアライメントを設計する」

16:10 ~ 16:23 ライトニングセミナー （発表10分・質疑3分）

JSR株式会社

青戸良賢 様 「産学連携による生命科学研究」

16:45 ~ 17:19 ショートトーク（後半・11名）

東大 学際情報学府 生物情報工学研究室

• 松本知也 「深層学習を用いたタンパク質リガンド相互作用予測」

慶應大 金井研

• 鶴巻萌 「小型なゲノムを有するCPRバクテリア群のリボソーム関連遺伝子解析」

東工大 山田研

• 城間博紹 「大腸がんを対象としたヒト腸内細菌叢のメタゲノム・メタボローム解析」

早大 浜田研

• 松谷太郎 「機械学習と育種」
• 白鳥哲嗣 「隠れ状態を含むモデルの情報量基準」
• 宮原雅人 「IRMの階層化とがん解析への応用」

東大 岩崎研

• 黒木健 「「半偽遺伝子」から解き明かすバクテリアのゲノム進化」
• 今野直輝 「代謝ネットワーク進化の軌道や収束点の検出とその可視化」
• 浜口悠貴 「系統・局在解析に基づく真核生物アミノアシルtRNA合成酵素データベースの構築」

慶應大 榊原・佐藤研

• 髙橋裕香 「ナノポアシークエンサーによるRNA修飾の計測」
• 堀田悠貴 「深層強化学習を用いた二次構造に基づくRNAデザイン」

17:20 ~ 17:30 写真撮影・閉会挨拶

18:00 ~ 20:00 懇親会

• 会場：東大 弥生キャンパス農学部食堂（研究会終了後にまとまって移動の予定）
• 会費：教員・研究員・企業の方等：2,000円 / 学生：1,000円

発表者の方々へ

発表スライドの形式は以下を満たして作成してくださるようお願い申し上げます．

• スライドの言語は英語を推奨いたします（口頭発表は日本語で構いません）
• フォントは25pt 以上
• スライドサイズは 4：3

共催のご案内

第3回研究会へご協賛していただける企業・団体の募集を締め切りました．

お申込みいただき誠にありがとうございました。

連絡先

tokyo.bio.meeting*gmail.com (*は @ に置き換えて下さい)

幹事

東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻 岩崎研究室

浜口 悠貴

東京工業大学情報理工学院情報工学系知能情報コース 石田研究室

佐藤 倫

慶應義塾大学大学院理工学研究科基礎理工学専攻生命システム情報専修 榊原研究室

上原 美夏

早稲田大学 先進理工学研究科電気・情報生命専攻 浜田研究室

天津 早貴