Siluriformes 

Família Loricariidae

 Ancistrus multispinis (Regan 1912) 
 Ancistrus taunayi Miranda Ribeiro 1918  
 Hemiancistrus fuliginosus Cardoso & Malabarba 1999 
Pareiorhaphis cerosa (Miranda Ribeiro 1951) 
Hisonotus aky (Azpelicueta, Casciotta, Almirón & Koerber 2004) 
Hisonotus charrua Almirón, Azpelicueta, Casciotta & Litz 2006. 
Hypostomus commersoni Valenciennes 1836 
Hypostomus isbrueckeri Reis, Weber & Malabarba 1990.  
Hypostomus luteus (Godoy 1980) 
Hypostomus regani (Ihering 1905)  
 Hypostomus roseopunctatus Reis, Weber & Malabarba 1990   
Hypostomus ternetzi (Boulenger 1895) 
 Hypostomus uruguayensis Reis, Weber & Malabarba 1990 
 Loricariichthys anus (Valenciennes 1835) 
 Loricariichthys edentatus Reis & Pereira 2000  
 Loricariichthys melanocheilus Reis & Pereira 2000  
 Paraloricaria vetula (Valenciennes 1835)   
 Pareiorhaphis hystrix (Pereira & Reis 2002)    
Pogonopoma obscurum Quevedo & Reis 2002 
 Rhinelepis strigosa Valenciennes 1840 
 Rineloricaria parva (Boulenger 1895) 
Rineloricaria quadrensis Reis 1983