Markku Pöyhönen on suorittanut Sibelius-Akatemiassa soitonopettajan tutkinnon vuonna 1981 ja pianodiplomin vuonna 1983. Pianonsoiton jatko-opintoja hän on harjoittanut Kööpenhaminan Kuninkaallisessa Konservatoriossa lukuvuonna 1984–1985 sekä lukuisilla kesäkursseilla opettajina mm. Stanislav Knor ja Nina Svetlanova. Lisäksi hän on suorittanut  HuK-tutkinnon Helsingin yliopistossa 1982 sekä filosofian lisensiaatin (2004) ja tohtorin (2011) tutkinnon Jyväskylän yliopistossa. Pöyhönen on voittanut I palkinnon valtakunnallisessa Ilmari Hannikainen -pianokilpailussa 1975 ja Sibelius-Akatemian sisäisessä Helmi Vesa -kilpailussa 1978.Hän on esiintynyt soolo- ja kamarimusiikkikonserteissa sekä eri orkestereiden solistina kotimaan lisäksi Virossa, Venäjällä ja Tšekkoslovakiassa. Jo opiskeluaikanaan hän toimi pianonsoiton lehtorina Savonlinnan ja Hämeenlinnan musiikkiopistoissa ja Jyväskylän yliopistossa. Suolahden musiikkikurssien ja kesäkonserttisarjan  johtajana hän toimi 1995–2004. Vuodesta 1985 alkaen hän työskenteli Keski-Suomen konservatorion pianonsoiton lehtorina, vuodesta 1990 apulaisrehtorina ja 1996–1998 vs. rehtorina. Hän on toiminut vuosina 1998–2000 Jyväskylän ammattikorkeakoulun kulttuurin koulutusalajohtajana, 2000–2011 yliopettajana, asiantuntemusalueenaan mm. instrumenttipedagogiikka ja tutkimusopinnot, sekä 2011–2012 lehtorina.  Lisäksi hän on toiminut Jyväskylän kaupungin kulttuurituottajana, kansainvälisten pianokilpailujen lautakunnan jäsenenä Venäjällä useaan otteeseen vuosina 2002–2020, EU:n hankehakemusten ulkoisena arvioijana sekä vapaana taiteilijana.  Vuosina 2018–2023 hän toimi Alajärven musiikkiopiston rehtorina.  

Markku Pöyhönen took a piano teacher’s degree at the Sibelius Academy in 1981 and a Bachelor of Arts degree at the University of Helsinki in 1982. He finished his studies in Helsinki with a soloist piano diploma (MA) at the Sibelius Academy in 1983. His post-graduate activities include studies at the Royal Conservatory of Copenhagen in the academic year 1984–1985 and on numerous summer courses, his teachers being e.g. Stanislav Knor and Nina Svetlanova.  In addition to that he has taken a PhD -degree (Music Education) at the University of Jyväskylä.  

Markku Pöyhönen won the first prize in the national Ilmari Hannikainen Piano Contest in 1975 and in the Helmi Vesa Contest for Sibelius Academy students in 1978. Mr. Pöyhönen has given several solo recitals, played in various chamber music ensembles, as well as been the soloist of symphony orchestras in Finland, Estonia, Russia and Czechoslovakia. Already during his studies Mr. Pöyhönen worked as a piano teacher at Savonlinna and Hämeenlinna colleges of music and at the University of Jyväskylä. He was the Artistic Director of Suolahti Music Courses and Summer Concert Series 1995–2004. Since 1985 he worked as a piano lecturer at the Conservatory of Central Finland, acting as the assistant principal in 1990–1996 and as the acting principal in 1996–1998. In 1998–2000 he worked as the Director of the School of Cultural Studies at JAMK University of Applied Sciences and 2000–2012 as the Principal Lecturer of instrument pedagogy and research at JAMK University of Applied Sciences, Jyväskylä, Finland. After that his activities have included working an external expert for the European Commission, as a producer at the department of culture at the municipality of Jyväskylä, as jury member in piano competitions and as an independent artist.  For five years he served as the principal of Alajärvi Music Institute the position from which he retired in  August 2023.