..Times Estimates using SNPs

This page is new and is in preparation

Counting the number of shared permanent SNP mutations among samples is supposed to provide the most accurate 
idea of how old relationships in deep ancestry were.

The largest problem is obtaining ideas on how to apply methodologies used to the samples available to us.  

This page is intended to try to provide the best estimates using what is available.  First, it is important to select
those areas of the Y chromosome that have provided the most reliable results.  We are here using the 42 areas
of the Y used in the 2013 Y study from Poznik et al. in Nature.  These seem the best chosen based on how they
went about selecting these.

The second step is choosing the number of years represented on average by a mutation. 
Most of the studies of the Y have estimated the age of the G group abt 50,000 yrs, the point at time when it
branched from haplogroup F.   So we can take the number of mutations found in the Poznik chromosome
areas and divide the 50,000 yrs by the mutation total.  The initial total count in one man is 393 mutations.
The result is 124 yrs per mutation, and that is the figure used below.  This is based on the info from a CTS342
sample.  There will be variations, and we will try to recalculate and provided an average when better info
is available.

The most samples we have currently for all these Poznik areas come from the 1000 Genomes Project.  These were 
originally sequenced at 4x -- similar to the Poznik study -- but it is clear that the resequencing (or additional sequencing) of 1000 
Genomes samples places them in the status of perhaps 8x or 10 because the size of the data files have doubled.  And 
the resequenced 1000 Genomes Project samples are much more reliable than earlier in many respects.  

All yrs shown are averages where more than one sample are available

50,000 yrs for all G -- midpoint of a possible range.  Year ago items (y.a.) are in blue & represents the estimated date when grp first emerged.
Because averages of samples sometimes used, there may be unexpected overlaps in start dates.

                <----------------22,816 yrs------------------>P287 grp exists<-------6,448 yrs---------->P15 grp exists<-------3,720 yrs----->L1259 grp exists
              /                                                                                       27,184 y.a.                                                              20,736 y.a.                                                   17,016  y.a.                         
M201                                                                                                                                                                                           \
                                                                                                                                                                                                         L293 grp exists<--9,548 yrs--->P16 grp exists
                                                                                                                                                                                                           19,974 y.a.                                           10,416 y.a.

                                                                                           Z6638 grp exists>------1,984yrs------------------->Z7940 grp exists-------------------> Z7941 grp exists
                                  FGC693 Groups            /        6,200 y. a.    \                                                                  4300-5300 y.a.    \ 
                                    FGC693<-------4,216 yrs------>                                       \                                                                                                        ------------->  Z7947 grp exists 
                                                                                        \                                           ----1,984 yrs----------------> Z7951 grp exists                                   
                                                                                          \                                                                                                      4000-5000 y.a
                                                                                                     Z6641 (Jewish & Ossetian) grp exists>-----------------------------
                                                                                                          6,200 y.a.

L1259 Groups

               <--124 yrs->L30 grp exists<-------2,976 yrs------->L141 grp exists<----868 yrs---->P303 grp exists<------------3,100 yrs---------->L140 grp exists
            /                              16,892 y.a.                                                       13,916 y.a.                                          13,048 y.a.                                                                      9,948 y.a.
L1259                                                                                                                                                                                                                                                              the L140 grp existed abt 496 yrs

 L140 Groups       

               ------>CTS342____________________________________  total existence of 9,424 yrs  for CTS342 grp
L140  ----->U1---------------------------------------------------------------  [likely same yrs as for CTS342 & L497]
            \___>L497______________________________________  total existence of 10,416 yrs for L497 grp
                                                                                                                           [this yr entry is a new entry & really needs to be averaged with the
                                                                                                                           CTS342 calculation which was used to calculate the overall yrs per
                                                                                                                           mutation -- which will drop the number of yrs per
                                                                                                                           mutation just a bit for everything here]


                                CTS342 -->Z724 -->Z1903-----------------------------  Z1903 grp emerged abt 9,300 yrs ago

                                                                                                                                          Z1903 apparently very early branch off of Z724

                                                     Z1903---->L640------------------------------total existence of 6,076 yrs for L640 grp

                                                                \___>Jewish grp______________total existence of 5,208 yrs for Jewish grp


                              L497----->CTS9737------>Z725 grp exists---------->L43----->L42 -----------  L43/L42 grp emerged abt 4,092 yrs ago
                                                                                                \________>Z726___> CTS4803______    Z726/CTS4803 grp emerged abt 4,000 yrs ago


An estimate of the PF3177 subgroup using data from a different source is abt 9240 yrs.