Fouille de Grands Graphes : Application à la bioinformatique

Luxembourg, 27 janvier 2015, dans le cadre de la conférence EGC'15

Après le  succès des  premières  éditions  de cet atelier qui s'étaient  déroulées  dans le cadre  d'EGC 2013 et 2014, avec des thématiques ouvertes sur la fouille de grands graphes. Cette  année,  nous  souhaitons  que  l’atelier  soit  plus  centré  sur  la  thématique  et  les applications en bioinformatique ou extraction d’information à partir données biologiques.

Programme :
Exposé invité :
13h 13h45
Etienne Birmelé (paris Decartes)
Enumération et statistiques pour l'étude des réseaux biologiques

Session exposés :
13h45 14h10
Maria Sorokina and David Vallenet. 
Graphe métabolique pour la recherche de chemins conservés de transformations chimiques


14h10- 14h35

Nicolas Dugué, Anthony Perez and Tennessy Kolubako. 
Détection de zones denses en triplets significatifs dans un réseau orienté


14h35 - 15h
 Charles Winterhalter, Rémy Nicolle, Mohamed Elati 
PEPPER: Optimisation multi-objective pour la recherche de complexes moléculaires dans des réseaux d'interaction protéiques


Proceeding : ici

Objectifs et thématiques :

L’édition  2015  de  l’atelier  fouille  de  grands  graphes  a  pour  but  de  réunir  les  chercheurs  intéressés  par  le  traitement,  la  fouille  et  la  visualisation  de  grands  graphes  et  leurs 
application dans les problématiques en bioinformatique.  Notre ambition est de permettre aux participants d'aborder  les problèmes rencontrés  liés  aux données biologiques et de présenter leurs approches de traitement.
De façon non limitative, nous sollicitons des communications sur les thématiques suivantes :

Analyse et dynamique des grands graphes
  • Recherche de communautés
  • Clustering de graphes
  • Graphes de voisinages
  • Analyse des réseaux bipartis
  • Recherche des motifs fréquents dans les graphes
  • Evolution des graphes et des communautés
  • Prévision des liens
  • Propagation de l'influence, flux d'informations
Applications Bioinformatique
  • Modélisation de réseaux biologiques
  • Prédiction de fonctions à partir de réseaux
  • Identification de voies métaboliques
  • Prédiction d’interaction
  • Analyse de données « Omique »
  • Réseaux de co-expression
Soumission :
Nous  proposons    une  soumission  classique  :  article  de  6  pages  maximum.  Les  articles décrivent des  travaux  aboutis  ou  en cours,  mais  aussi  des  états  de  l'art  sur une  question particulière. Une large place est laissée pour les discussions. Les  articles  soumis  ne  doivent  pas  dépasser  6  pages  en  suivant  le  format  d'EGC  (voir http://www.antsearch.univ-tours.fr/rnti).

Dates importantes :
Date limite de soumission :   28 novembre 2014   5 décembre 2014
Notification aux auteurs :     15 décembre 2014  19 décembre 2014
Version finale :        5 janvier 2015
Mise en ligne du programme :    6 janvier 2015

Les actes de l'atelier seront de plus mis à disposition sur le Web. Les soumissions sont à faire via le site easychair : lien de soumission
( Si vous arrivez pas a soumettre sous easychair, vous pouvez nous envoyer votre soumission a hanczar_blaise AT yahoo.fr )

Organisateurs :
Mohamed Elati (ISSB – Université d’Evry)
Blaise Hanczar (LIPADE -  Université Paris Descartes)
Lydia Boudjeloud-Assala (LITA – Université de Lorraine)

Comité de programme : (en cours)