Dinámica Molecular (MD)


Estos tutoriales los he seleccionado de lo mejor que he descubierto en la web...

Que es la Ciencia de Materiales:

Que es ciencia computacional de materiales?: Esta es una presentación dedicada a comprender lo que es y significa la moderna área de investigación que se abrió con la llegada de la computadora al estudio de los materiales.

INTRODUCCION A LA DM: 

A MD introductorio: Excelente tutorial a nivel introductorio escrito por Furio Ercolessi del International School for Advanced Studies (SISSA-ISAS) en Trieste, Italy. revisa su pagina www.sissa.it siempre tienen posiciones doctorales.

MD con el potencial LJ: Este es otro tutorial básico, en el cual se desarrollan simulaciones basadas en el potencial de Lennard-Jones pero con una visión general, y con la inclusión de los conceptos estadísticos .

MD de Argon: Un simple tutorial de como realizar una simulación MD de Argón en estado gaseoso empleando el potencial de Lennard-Jones.

Potenciales Interatómicos: Es una interesante introducción a los Potenciales Interatómicos. La selección del potencial es una parte muy importante en MD ya que en este contiene las propiedades del sistema, ya sea un gas, liquido o solido. Leer muy bien este tutorial...!

Ecuaciones de Movimiento: Como sabemos el movimiento de los cuerpos esa descrito por las ecuaciones de movimiento, este tutorial es una breve introducción a las ecuaciones diferenciales d movimiento y como resolverlas.

Presión en MD: Como se calcula la presión de un sistema de partículas en simulaciones de MD.

Bases de MD: Aquí se trata la idea básica de la Dinámica Molecular, un poco de historia, y de como se desarrolla todo el esquema de la simulación, desde el algoritmo, código, ideas de optimización e interpretación de los resultados.

COMO DESARROLLAR UNA SIMULACION DM:

Que estudiamos en una simulación DM?: Aquí se presenta a nivel introductorio los diferentes tipos de análisis que podemos realizar con base en los datos obtenidos por medio de simulaciones de DM.

Funciones de correlación: Otra herramienta poderosa no solo en el análisis de resultados sino también en el análisis de la simulación durante su desarrollo son las funciones de correlación.

Sólidos ideales: Lo primero que hay que conocer para iniciarse en en mundo de la simulación de materiales es la manera como esto se ven en el mundo de las simulación para esto nada mejor que estudiar cristales ideales. (NUEVO)

Mecánica estadística de la MD: Este es un de los capítulos mas importantes de MD y en esta podremos entender en que lugar de la Física Estadística están sentadas las bases de las simulaciones MD.

Teoría de la MD: Aquí se da una introducción a las base a la dinámica molecular con base a en la solución del problema de muchos cuerpos (átomos) y los diferentes conjuntos estadísticos y el principio de ergodicidad, lo mas importante es que en esta lección se presenta de manera muy sencilla la conexión entre la estadística y la medida de las propiedades termodinámicas. (NUEVO)

Fuerzas entre átomos: Aquí se estudia como calcular la fuerza de interacción entre átomo y además se explican algunos tipos muy importantes de potenciales para la simulación de sólidos, además se presenta una comparación de  resultados obtenidos por medio de simulaciones para algunos potenciales con resultados experimentales. (NUEVO)

Modelo de las interaccione atómicas: El modelamiento de las interacciones atómicas por medio de potenciales depende de la complejidad de las fuerzas actuantes, ya que no es lo mismo dos átomos interactuando que varios al mismo tiempo, así de esta manera se han desarrollado diferentes aproximaciones para tener en cuenta sistemas complejos y con dependencia angular.(NUEVO)

A continuación unos cursos completos de Dinámica Molecular: (NUEVO)

Estos tutoriales introductorios y los intermedios son suficientes para que emprendan el camino hacia desarrollar sus primeras simulaciones, lo primero es empezar por modelar gases (Argón esta bien ya que hay un tutorial de este)  en dos dimensiones y obtener las variables termodinámicas, entonces espero sus preguntas.... Saludos, Edmanuel Torres.


Recursos adicionales:

Programa para visualizar partículas: www.xmol.org