the Drosophila tracheal system

Schematics and Photos of the Drosophila tracheal system 

                            Genetic mosaic, homozygous cells marked with GFP
 

 

Antibody staining of seamless tubes in terminal cells of a third instar larvae

whacked mutant terminal cell, discontinuous lumens 

whacked mutant terminal cell (green - cytoplamic GFP, red - lumenal antigen) 

 

List of Tracheal genes

Gene                                Encoded product                                         Study

    
PLACODE           
trachealess (trh)                            bHLH PAS transcription factor                                Wilk et al., 1996; Issac et al., 1996;
tango (tgo)                                    bHLH PAS transcription factor                                Sonnenfield et al., 1997; Ward et al., 1998
ventral veins lacking (vvl)/drifter     POU-homeodomain transcription factor                   Anderson et al., 1995; Llimargas M, Casanova J., 1997
           
FGF SIGNALING           
breathless (btl)                              FGFR (branchless receptor)                                    Klambt et al., 1992
branchless (bnl)                            FGF                                                                        Sutherland et al., 1996
stumps (sms)/dof/hbk                    FGFR adaptor protein                                             Imam et al., 1999; Vincent et al., 1998;  Michelson et al.,                                                                                                                                    1998
sprouty (sty)                                  Inhibitor of RTK signaling                                        Hacohen et al., 1998
sugarless                                      UDP- D-glucose dehydrogenase                             Lin et al., 1999
sulfateless                                    heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase   Lin et al., 1999
Heparan sulfate 6-O-sulfotransferase (dHS6ST)          dHS6ST                                    Kamimura et al, 2001
pointed (pnt)                                 An ETS-box transcription factor                               Scholz et al., 1993
anterior open (aop)/yan                An ETS-box transcriptional repressor                       Oshiro et al., 2002
           
DPP SIGNALING           
punt (put)                                    TGFb receptor type II                                                Vincent S, et al., 1997; Wappner P, Gabay L, Shilo BZ.,                                                                                                                                     1997
thickveins (tkv)                             TGFb receptor type I       
nejire (nej)                                    CBP- cytoplasmic adaptor                                       Takaesu et al., 2002
Mothers against DPP (Mad)          SMAD transcription factor    
           
WG SIGNALING           
wingless (wg)                               WNT ligand                                                                Chihara T, Hayashi S., 2000; Llimargas M., 2000
frizzled (fz) and frizzled-2 (fz2)      WNT Recepors      
armadillo (arm)                             β-catenin     
pangolin (pan)/dTCF                    TCF – an HMG-box transcription factor   
porcupine (por)                            ER-localized protein     
           
TGF-α SIGNALING           
spitz (spi)                                      TGF-a type ligand                                                        Wappner P, Gabay L, Shilo BZ., 1997
faint little ball (flb)/Egfr                   EGFR                                                                          Wappner P, Gabay L, Shilo BZ., 1997
Star                                               Ligand processing                                                       Wappner P, Gabay L, Shilo BZ., 1997
rhomboid                                       Serine peptidase  - ligand processing                          Wappner P, Gabay L, Shilo BZ., 1997
           
HH SIGNALING           
hedgehog (hh)                              Ligand                                                                         Glazer L, Shilo BZ., 2001
patched (ptc)                                 Receptor                                                                     Glazer L, Shilo BZ., 2001
           
TUBE DIAMETER and EXPANSION           
mummy (mmy)/ cystic                    UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase       
knickkopf (knk)/gnarled                 dopamine beta-monooxygenase        
krotzkopf verkehrt (kkv)                 chitin synthase       
retroactive (rtv)                              Molecular function unknown                                        Moussian et al., 2006
varicose                                        MAGUK domain septate jxn protein                             Wu et al., 2007
Lachesin (lac)/bulbous                                                                                                     Llimargas et al., 2004
nervana-2 (nrv2)/ectatic                Sodium/potassium ATPase                                          Beitel and Krasnow, 2000; Wu and Beitel, 2003; Paul                                                                                                                                         et al., 2003
ATPα                                            Sodium/potassium ATPase                                         Paul et al., 2003
sinuous                                         claudin                                                                        Wu et al., 2004
convolulted                                   Molecular identity unknown       
megatrachea                                claudin                                                                        Behr et al., 2003
polished rice (pri)                            4 tiny peptides                                                           Kagey et al., 2007
grainyhead                                    GFH-CP2-type transcription factor                              Hemphala et al. 2003
vermiform                                       Chitin deactylase        
serpentine                                      Chitin deactylase       
wurst                                                                                                                                (Behr et al., 2007)
           
TRANSCRIPTION FACTORS (MISC.)           
blistered (bs)/SRF                         Transcription factor       
knirps                                            Zinc finger transcription factor                                      Vincent et al. 1997, Chen et al. 1998, Ribeiro et al.                                                                                                                                             2002
knirps-like                                      Zinc finger transcription factor                                      Vincent et al. 1997, Chen et al. 1998, Ribeiro et al.                                                                                                                                             2002
spalt                                              Zinc finger transcription factor                                      Kuhnlein & Schuh 1996
apontic (apt)/trachea defective       bZIP transcription factor                                              Eulenberg KG, Schuh R., 1997

hindsight/pebbled                      Zinc finger transcription factor                                  Wilk et al., 2000
hunchback                                    Zinc finger transcription factor                                       Wolf and Shuch, 2000
Mrtf/dMal                                       Transcription factor       
dysfusion                                       bHLH PAS transcription factor       
ribbon (rib)                                     BTB & pipsqueak domain transcripton factor               Shim et al., 2001; Bradley and Andrew, 2001
elbow                                            Zind finger transcription factor                                      Dorfman et al., 2002
noc                                                Zind finger transcription factor                                      Dorfman et al., 2002
jing                                                Transcription factor       
emc                                               Transcriptional co-repressor       
stat                                                Transcription factor       
escargot (esg)                                bHLH transcriptional repressor                                    Samakovlis et al., 1996
hairy                                              Transcriptional repressor                                              Myat et al., 2005
pebbled (peb)/hindsight (hnt)         Transcription factor                                                      Wilk et al., 2000
Dhr78                                            Hormone receptor/transcription factor       
stripe (sr)                                       Transcription factor       
unplugged (unpg)                         Transcription factor       
           
OTHER           
Lamin/misguided                            lamin      
multiple edematous wings (mew)    a-Integrin       
inflated (if)                                      a-Integrin       
myospheroid (myo)                         b-Integrin       
rhea/tendrils                                   Talin                                                                                Levi, Ghabrial, and Krasnow, 2006
klarsicht                                          Microtubule based transport                                            Myat et al., 2005
anduril                                            Molecular identity not known                                            Myat et al., 2005
gimli                                                Molecular identity not known                                            Myat et al., 2005
gloin                                               Molecular identity not known                                             Myat et al., 2005
fangorn                                          Molecular identity not known                                             Myat et al., 2005
Dmsar                                            Small GTPase                                                                    Zhu et al., 2005
MMP                                              Matrix metaloprotease       
ninjurin                                          Molecular function unknown       
capricious           
tartan           
Blimp-1           
Daam                                            formin       
Hsp60C           
abnormal wing discs (awd)            Nucleoside diphosphate kinase                                            Dammai et al., 2003
piopio (pio)                                    ZP domain protein       
dumpy (dp)                                    HUGE ZP domain protein       
fear of intimacy (foi)                       Zinc ion transporter       
pickpocket                                     Family of sodium channels       
MBF                                              Transcriptional cofactor       
shortstop (shot)                             spectroplakin       
rhoA                                             Small GTPase       
headcase (hdc)                            Molecular function unknown       
dVhl                                             Ubiquitin ligase       
DE-cadherin/shotgun (shg)           E-Cadherin       
congested-like trachea (colt)         Carnitine antiporter       
pollux                                           RabGAP       
Rac                                               Small GTPase       
adrift                                             Molecular function unknown       

fat-like (ftl)                                   Cadherin                                                                                 Castillo-Lopez et al., 1993                                          

NOTCH SIGNALING           
Notch (N)                                        Receptor       
Delta (Dl)                                         Ligand       
Serrate (Ser)                                   Ligand          
echinoid (ed)           
           
OTHER SIGNALING           
corkscrew           
rhomboid-3           
roundabout-1                                Receptor       
roundabout-2                                Receptor       
slit    Ligand       
domeless (dome)                           Receptor      

polychaetoid (pyd)                        ZO-1 homolog      

List not complete and many citations need to be added - apologies to     those whose work is not yet listed


Back to Home Page