Pada tahun 1997 berdirilah Yayasan Pendidikan Putra Pertiwi. Kemudian membuka TK dan Play Grup Putra Pertiwi tahun 1998. TK dan Play Grup Putra Pertiwi mulai aktif tahun pelajaran 1998/1999, awal perintisan membuka 2 kelas TK A dan TK B. Tahun 1999 membuka Play Grup Besar dan Kecil umur 2-3 tahun. Kemudian Yayasan Pendidikan Putra Pertiwi membuka jenjang pendidikan dari TK ke SD. SD Putra Pertiwi berdiri sejak tahun 2001 di bawah naungan Yayasan Pendidikan Putra Pertiwi. Sudah lebih dari 25 tahun Sekolah Putra Pertiwi mendidik putra - putri penerus bangsa membekali siswa dengan iman dan taqwa sejak usia dini sesuai agama yang dianutnya. Melalui kegiatan bidang keagamaan SD Putra Pertiwi (perayaan hari besar keagamaan serta melaksanakan ibadah rutin sholat wajib dan sunnah berjamaah, serta tadarus Al Qur'an bagi siswa Muslim, ibadah pagi dan siang bagi siswa Kristen dan Katolik, serta pelajaran khusus dari pemuka agama Hindu atau Budha serta Khong Hu Cu).

Tidak hanya ilmu yang mengasah kecerdasaan saja yang diberikan, namun membangun sikap kebhinekaan global dengan menanamkan sikap toleransi yang tinggi terhadap perbedaan suku, agama dan ras. Tenaga pengajaran di SD Putra Pertiwi merupakan pilihan yang berkompeten dalam bidangnya, dengan perpaduan tenaga pengajar senior yang sudah mumpuni dalam bidang penanganan anak dan pendalaman moral yang baik dan guru yang masih muda tentunya akan lebih cepat dan sigap dalam mencari dan merancang pembelajaran yang menarik dan berbasis IT. 

Menggunakan kurikulum nasional berorientasi internasional berdasarkan Multiple Intelegences (MI) dan metode belajar active learning, yaitu dengan konsep pembelajaran: Bilingual (Bahasa Indonesia dan Bahasa Inggris) untuk kegaitan sehari-hari, mengajarkan sejak dini pelajaran teknologi komputer, pendampingan 2 orang guru untuk setiap kelas pada kelas 1, 2, dan 3, Pelayanan Prima dari guru-guru terbaik yang telah diakui oleh masyarakat sebagai keunggulan utama SD Putra Pertiwi selama ini, Perenting sebagai program pendampingan yang sekolah berikan kepada orang tua atau wali siswa, Putra Pertiwi Exhibition menampilkan karya terbaik siswa SD Putra Pertiwi, Putra Pertiwi Talent menampilkan kreatifitas dan membangun kepercayaan diri para siswa, membangun kesadaran bernalar dan berfikir kritis sejak usia dini melalui penerapan High Order Thingking Skill (HOTS) dalam kegiatan evaluasi dan capaian pembelajaran. Selain Kegiatan Belajar Mengajar (KBM) yang dioptimalkan, SD Putra Pertiwi juga membangun minat dan potensi siswa pada semua bidang melalui kegiatan Extrakurikuler yang beragam: Drumband, Seni lukis, Seni tari Pianika, English Club, Science Club, Pramuka, Juzitzu dan Karate yang diadakan di sekolah maupun kegiatan di luar sekolah seperti Field Trip.

Berkemajuan dalam IMTAQ dan IPTEK yang Membentuk Generasi Berkarakter di Lingkungan ASRI (Andal, Sehat, Ramah, dan Inspiratif).

1. Membekali peserta didik dalam bidang pengetahuan, sikap, dan keterampilan sesuai dengan kompetensi dasar yang telah ditetapkan.

2. Membekali peserta didik dalam IMTAQ dengan kegiatan keagamaan sesuai dengan agama yang dianut.

3. Meningkatkan toleransi umat beragama dengan menyediakan sarana yaitu organisasi keagamaan sesuai agama yang dianut oleh peserta didik.

4. Mengembangkan bakat dan minat peserta didik melalui Bina Prestasi dan Komunitas Belajar.

5. Menanamkan sikap jujur, disiplin, percaya diri, peduli lingkungan dan alam sekitar.

6. Membudayakan 5S (Senyum, Salam, Sapa, Sopan, Santun).

7. Meningkatkan K7 (Kebersihan, Kerapian, Keindahan, Keamanan, Kekeluargaan, Kerindangan, dan Kesehatan) oleh seluruh warga sekolah.