扶桑蜻蜓在臺灣幾乎可以說是北部限定,大部分族群分布在低海拔山區,有少部分族群則是可以分布到近2000公尺,低海拔成蟲3-4月開始出沒,至5月就開始減少,而高海拔的族群則比較晚,到7-8月還會有成蟲。
臺灣產的扶桑蜻蜓原為 Orthetrum japonicum (Uhler, 1858) 的一個亞種O. japonicum internum McLachlan, 1894,Karube et al. (2012) 所提出的分子系統發育樹不支持O. japonicum 為單系群,但支持指名亞種與internum亞種存在顯著的遺傳差異,Karube et al. (2012) 也同時點出多個形態特徵的差異將internum 這個亞種提升為種。
因此現在臺灣產的扶桑蜻蜓應使用 Orthetrum internum McLachlan, 1894
參考文獻: Karube, H., Futahashi, R., Sasamoto, A. & Kawashima, I. 2012. Taxonomic revision of Japanese odonate species, based on nuclear and mitochondrial gene genealogies and morphological comparison with allied species. Part I. Tombo 54: 75-106.