Suy thoái môi trường nước là tình trạng chất lượng nước trong các hệ thống tự nhiên như sông, hồ, suối, biển hoặc nước ngầm bị giảm sút, không còn đáp ứng được các mục đích sử dụng cơ bản như cung cấp nước sạch, bảo vệ hệ sinh thái, hoặc phục vụ sản xuất và sinh hoạt. Những biểu hiện rõ nét của suy thoái môi trường nước bao gồm xâm nhập mặn, ô nhiễm nguồn nước, cạn kiệt nguồn nước,... 

Hội An từng ghi nhận ô nhiễm nước nghiêm trọng tại khu vực Chùa Cầu vào năm 2018. Nước dưới cầu bị bốc mùi hôi thối do hệ thống thu gom nước mưa bị tràn nước thải sinh hoạt từ kênh Ồ Ồ (phường Cẩm Phô). Nước thải chảy vào hồ điều tiết, gây ô nhiễm trước khi ra sông Hoài, làm ảnh hưởng đến cả cảnh quan lẫn cuộc sống người dân.