בעבר היה מיקולוב מרכז יהודי מורביה. הישיבה המקומית הייתה מפורסמת ונהנתה מפורסם יוצא דופן. מאמצע המאה ה -16 ועד 1851, הוא היה מקום מושבם של רבני מוראביה. כאן עבדו הרבנים יהודה לוב בן בכאל (מהר"ל), הרב לאו, מלומד, מחנך, מקובל, על פי אגדת הגולם ודוד בן אברהם אופנהיימר. שניהם הפכו לרבנים הראשיים של פראג.
הרובע היהודי ממוקם ב- Zámecký vrch. 90 בתים השתמרו ממנה, מחציתם מונומנטים תרבותיים המוגנים על ידי המדינה. בית הכנסת העליון, שנבנה מחדש בסגנון הבארוק, מתוארך לשנת 1550.
בית הקברות היהודי נוסד במאה ה -15. יש בה 4,000 מצבות, הקריאה הוותיקה ביותר היא משנת 1605. רבנים מפורסמים קבורים על הגבעה הרבנית, כמו מנחם מנדל בן אברהם קרוכמל, במקור מקרקוב (מחבר מערכת חוק שי תקנות) ושמואל שמלקה בן הירש. הלוי הורוביץ עם מרדכי בן אברהם בנט, שממנו נגזרות שתי שושלות חסידיות מפורסמות בארצות הברית. את קברי הרבנים סוגדים מבקרים מכל רחבי העולם.
עורך הדין והסופר יוזף פון זוננפלס או היחצן והמשורר הירונימוס לורם (היינריך לנדסמן), מחבר האלפבית המישוש של לורם לחירשים, נולד במיקולוב.