Eventos de muestreo

Mis datos son 'Eventos de muestreo' si:

  • No solo documentan atributos en un contexto de una especie, sino también detalle suficiente para determinar la composición de una comunidad o abundancia relativa de las especies en diferentes momentos del tiempo.
  • Provienen de protocolos estandarizados para medir y observar la biodiversidad, con una medida de la abundancia de especies en la muestra.
  • Corresponden a: muestreos a lo largo de los años en parcelas permanentes o censos estandarizados, muestras de suelos para análisis metagenómicos, caracterizaciones de fitoplancton, etc.

¿Cómo publicar eventos?


1. Registra tu organización

Para iniciar el proceso formal de publicación de tus datos, es necesario que tu organización esté registrada como socio publicador del SiB Colombia. Puedes comprobar en este enlace si ya es así. En caso contrario, es muy sencillo hacer parte de la red de socios, sólo debes diligenciar el Formulario Único de Registro

Conjunto de datos ejemplo:

Caracterización de fitoplancton

INVEMAR

Comportamiento espacio-temporal de la densidad fitoplanctónica en el año 2015 Magdalena, Colombia

2. Estandariza tus datos

Tus datos necesitan ser transformados en una estructura de tabla utilizando los términos del estándar Darwin Core (DwC) como encabezados de columna.

Evento

Los datos del evento corresponden al momento en el tiempo en el que la muestra es tomada, por ejemplo:

  • Cuando una muestra de fitoplancton es tomada en un tiempo y lugar conocidos, para luego ser caracterizada.
  • Cuando una muestra de lodo es tomada en un tiempo y lugar conocidos, para luego hacer análisis metagenómicos.
  • Cuando una parcela de bosque es evaluada en un tiempo y lugar conocidos.

Para realizar esto utiliza la Plantilla de eventos de muestreo .

Datos asociados de organismos

Los datos asociados al evento corresponden en primera instancia a los registros biológicos se los organismos asociados al evento realizado, por ejemplo:

  • Los 26 taxones de la clase Dinophyceae identificados a género en un evento de muestreo de fitoplancton
  • Los 42 reads de bacterias obtenidos para una muestra de lodo
  • Las 15 especies identificadas en una parcela

Para realizar esto utiliza la Plantilla de registros biológicos del SiB Colombia si son observaciones, colectas temporales o si los organismos asociados al evento son colectados y preservados en una colección. También puedes generar tu propia plantilla a través del Generador de Plantillas Excel - DwC.

Datos adicionales

Adicionalmente es posible asociar datos fisicoquímicos al evento de muestreo (pH, temperatura, nivel de carbono, etc.) y medidas o hechos a los organismos (área foliar, referencias, secuencias, etc.). Si deseas agregar este tipo de datos adicionales por favor contáctanos.

3. Mejora la calidad de tus datos

Verifica y mejora la calidad de los datos de tu lista haciendo uso de herramientas que te permiten identificar, limpiar y corregir posibles errores geográficos, taxonómicos, de formato, entre otros. Quiero saber más sobre Calidad de Datos!

4. Carga tus datos en línea

Antes de cargar tu lista, debes contar con las credenciales para acceder a la herramienta de publicación (IPT). Para obtenerlas y conocer el proceso de carga contactate con el administrador del IPT donde deseas publicar y ten en cuenta las siguientes recomendaciones:

  • Elimina la fila que tiene los nombres del estándar en español.
  • Exporta tus datos desde la plantilla Excel como archivo de texto (TXT) delimitado por tabulaciones.
  • No modifiques ninguna de las opciones de carga a menos que sepas lo que estás haciendo.

5. Mapea tus datos

Para indicarle al IPT que datos se van a subir debes realizar la correspondencia de los elementos de tu plantilla con los nombres de los elementos en la herramienta IPT, realiza esto en la sección Mapeo Darwin Core de tu recurso.

No olvides seleccionar Darwin core event antes de hacer clic en Agregar:

Luego de mapear los datos del evento debes mapear los datos asociados utilizando la plantilla de observaciones o colecciones como una extensión:

6. Completa tus metadatos

En la sección Metadatos del IPT, documenta toda la información que permite dar un contexto a tus datos. En total hay 12 secciones en donde podrás ingresar información relacionada con los contactos del recurso, las licencias de uso, la cobertura geográfica y la metodología, entre otras.

7. Publicación del recurso

Cuando hayas completado correctamente los datos, su mapeo y los metadatos envía un correo al administrador del IPT para finalizar la publicación de tu recurso. El correo debe tener como asunto “Publicar recurso” y debe contener:

  • Tu nombre
  • El nombre de tu organización
  • El nombre del recurso que quieres publicar
  • La URL de la 'vista general del recurso' después de publicado
  • Tu conjunto de datos adjunto en formato de texto (excel, txt o csv)

Una vez el administrador verifique que el recurso y los datos a publicar se encuentran en un estado óptimo, enviará una notificación de la publicación exitosa a través de correo electrónico o te informará en caso de encontrar alguna inconsistencia en el proceso.

¿Dónde puedo ver mis eventos publicados?

Las listas que se publican a través del SiB Colombia son visibles en:


- Herramienta de publicación IPT

- Eventos de muestreo - GBIF