Eventos de muestreo

Mis datos son 'Eventos de muestreo' si:

  • No solo documentan atributos en un contexto de una especie, sino también detalle suficiente para determinar la composición de una comunidad o abundancia relativa de las especies en diferentes momentos del tiempo.
  • Provienen de protocolos estandarizados para medir y observar la biodiversidad, con una medida de la abundancia de especies en la muestra.
  • Corresponden a: muestreos a lo largo de los años en parcelas permanentes o censos estandarizados, muestras de suelos para análisis metagenómicos, caracterizaciones de fitoplancton, etc.

¿Cómo publicar eventos?


1. Registra tu organización

Para iniciar el proceso formal de publicación de tus datos, es necesario que tu organización esté registrada como socio publicador del SiB Colombia. Puedes comprobar en este enlace si ya es así. En caso contrario, es muy sencillo hacer parte de la red de socios, sólo debes diligenciar el Formulario Único de Registro

Conjunto de datos ejemplo:

Caracterización de fitoplancton

INVEMAR

Comportamiento espacio-temporal de la densidad fitoplanctónica en el año 2015 Magdalena, Colombia

2. Estandariza tus datos

Tus datos necesitan ser transformados en una estructura de tabla utilizando los términos del estándar Darwin Core (DwC) como encabezados de columna. Los eventos de muestreo se componen de 3 partes, que se explican a continuación.

Evento

Los datos del evento corresponden a la descripción de la metodología de muestreo en un contexto temporal y espacial, por ejemplo:

  • Cuando una muestra de fitoplancton es tomada en un tiempo y lugar conocidos, para luego ser caracterizada.
  • Cuando una muestra de lodo es tomada en un tiempo y lugar conocidos, para luego hacer análisis metagenómicos.
  • Cuando una parcela de bosque es evaluada en un tiempo y lugar conocidos.

Para realizar esto utiliza la Plantilla de eventos de muestreo.


Datos asociados al evento

Es posible asociar medidas abióticas del evento de muestreo (pH, temperatura, nivel de carbono, etc.). Si deseas agregar este tipo de datos, menciónalo en el correo y la persona encargada desde el EC-SiB lo apoyará en la estructuración y ajuste de los datos al estándar Darwin Core.

Si los registros tomados durante el evento son observaciones, colectas temporales o si los organismos asociados al evento son colectados y preservados en una colección, utiliza la Plantilla de registros biológicos del SiB Colombia para registrarlos. También puedes generar tu propia plantilla a través del Generador de Plantillas Excel - DwC. También puedes incluir


Datos asociados a organismos

Recuerda que también es posible asociar medidas o hechos (área foliar, referencias, secuencias, etc.), imágenes, videos, sonidos, etc. de los organismos, si deseas agregar este tipo de datos, menciónalo en el correo y la persona encargada desde el EC-SiB lo apoyará en la estructuración y ajuste de los datos al estándar Darwin Core.

3. Mejora la calidad de tus datos

Verifica y mejora la calidad de tus datos haciendo uso de herramientas que te permiten identificar, limpiar y corregir posibles errores taxonómicos, geográficos, de formato, entre otros. Quiero saber más sobre Calidad de Datos!

4. Contacta al Equipo Coordinador del SiB Colombia

Cuando hayas estructurado los datos al estándar Darwin Core y realizado las correcciones de calidad que consideres necesarias, escribe al SiB Colombia un correo con el asunto “Publicar recurso + nombre de la organización”, no olvides mencionar en el correo:

  • Tu nombre
  • El nombre de tu organización
  • Una breve descripción del conjunto de datos que deseas publicar
  • Tu conjunto de datos adjunto en formato de texto (excel, txt o csv), (Ver paso 5).
  • Si es la primera vez que tu organización publica datos a través del SiB Colombia, envía también el logo de tu entidad en formato vectorial (.png, .pdf, .svg, .eps, etc.)

Una vez envíes el correo, una persona del Equipo Coordinador del SiB Colombia (EC-SiB), se encargará de apoyarte durante el proceso de publicación.

5. Acompañamiento a la publicación

La persona encargada de apoyarte durante el proceso de publicación hará una revisión detallada sobre el conjunto de datos que envías, haciendo las sugerencias necesarias en caso de encontrar inconsistencias en la estandarización o en la calidad de los datos. El proceso de acompañamiento incluye la creación del recurso en la herramienta de publicación - IPT, y la carga de los datos con las respectivas validaciones.

Durante el proceso de acompañamiento pueden surgir dudas y vamos a necesitar de tu ayuda, a tu correo se enviarán los comentarios, preguntas y sugerencias para la publicación del conjunto de datos.

6. Completa tus metadatos

Una vez finalice la revisión de calidad de los datos por parte del EC-SiB, recibirás un correo con el enlace al recurso en la herramienta de publicación - IPT y las credenciales de acceso (en caso que aún no las tengas), para que inicies la documentación de los metadatos del nuevo recurso.

En la sección Metadatos del IPT, debes documentar la información que da contexto a tus datos. En total hay 12 secciones en donde ingresarás la información relacionada con: los contactos del recurso, las licencias de uso, la cobertura geográfica, la metodología, entre otras.

7. Publicación del recurso

Una vez se verifique desde el EC-SiB que el recurso se encuentra en un estado óptimo, se realizará la publicación, asignación del identificador único digital (DOI) y registro ante la Infraestructura Mundial de Información sobre Biodiversidad (GBIF). Al finalizar recibirás una notificación sobre la publicación exitosa del recurso.

¿Dónde puedo ver mis eventos publicados?

Las listas que se publican a través del SiB Colombia son visibles en: