カンキツ、ブドウ、リンゴ、キク、サツマイモについて、主要な品種のDNA配列多型情報を格納しています
本データベースに格納しているデータは農林水産省・みどりの食品システム戦略実現技術開発・実証事業(品種識別の開発)の成果によるものです
本データベースに格納しているデータは下記の手順で解析されています。・バリアントコール:Illumina Dragen v3.8
・フィルタリング:vcftools, QUAL≥30, 10≤DP≤200,GQ≥20, max-missing=1.0
参照ゲノム配列:CUNuph_r1.0
品種数:23
参照ゲノム配列:VSMuph_r2.0
品種数:17
参照ゲノム配列:Mdomestica_491_GDDH13v1.1
品種数:20
参照ゲノム配列:Gojo-0 v1
品種数:14
参照ゲノム配列:Itr_r2.2
品種数:24
公開されている品種識別マニュアルへのリンクサイト