原薗 陛正 (Harazono Yoritaka)

東大新領域・メディカル情報生命専攻 笠原雅弘研究室

博士3年（2019年進学）

研究テーマ

グラフ構造を用いたヒト参照配列におけるアノテーション情報のリフトオーバー

副専攻

WINGS GLAFS(IOG:高齢社会総合研究機構 主宰) 奨学生

開発経験

• ヒト遺伝子バリアントデータを元にグラフゲノムを構築するパイプライン(Ruby)(主専攻)

• ナノポアシークエンサーに特有のエラー傾向を可視化するパイプライン(C++)(主専攻)

• Dotplotをインタラクティブに表示するスクリプト(Python3)(主専攻)

• 異なるアセンブリ間のchain情報をインタラクティブに表示するブラウザー(Python3 + javaScript)(主専攻)

• NGSリード中に頻出するk-merを集計するプログラム(Rust)(主専攻)

• 実験自動化における自然言語->マシンコードの翻訳プログラム(Python3)(アルバイト)

• 実験自動化におけるロボットの動作確認のためのプラットフォーム(C# in Unity)(アルバイト)

• 大規模実験データのRDF変換プログラム(Python3)(アルバイト)

• 複数フォーマットの名簿の自動生成(VBA)(アルバイト)

• 元素をテーマにしたボードゲーム(Python3)(趣味)

• けものフレンズを題材としたアクションゲーム(C# in Unity)(趣味)

GitHub

https://github.com/harazono/

経歴

2017.3 東京理科大学 理工学部 情報科学科 卒業

2017.4 東大新領域・メディカル情報生命専攻 博士前期課程入学

2018.2 ゲノムグラフ研究会立ち上げ

2018.4 GLAFS 入校(5期生)

2019.3 東大新領域・メディカル情報生命専攻 博士前期課程修了

2019.4 東大新領域・メディカル情報生命専攻 博士後期課程入学

趣味

国内旅行/バイクツーリング(大型自動二輪持ってます)/料理, お菓子作り/サバゲー/日曜大工/けものフレンズ/ラブライブ/ゼルダの伝説BotW/フィットボクシング2/ほか多数

その他