Awal mula sekolah SMP SUNAN KALIJAGA berawal dari pemilik ini mempunyai penyakit jantung di tahun 1984, dan pendiri ini berkata jika beliau sembuh dari penyakit jantungnya, beliau akan mendirikan lembaga pendidikan untuk orang orang yang tidak mampu, akhirnya berdirilah sekolah ini pada tahun 1985.

Taqwa,terpelajar, berakhlak mulia dan eksis di masyarakat.

1. meningkatkan ketaqwaan serta kemampuan melaksanakan peribadatan secara islam dengan baik.

2. meningkatkan suasana belajar kondusif dan agamis.

3. menumbuhkan semangat serta antusias untuk berjuang memerangi ketidakberdayaan.

4. menumbuhkembangkan budaya kerja keras serta disiplin tinggi terhadap tugas dan tanggung jawab.