Promoter sequences of OXS2 - SOC1 - LFY - FUL - AP1 - TFL1 Tags are in red. Each tag (<>) is coupled with an end tag (</>). The green number in parenthesis is the coordinate of the preceding base. <Fwd_Primer>c(‑1147)gccggaaaataaatcctcc</Fwd_primer> taaagaaatatttttagatgtgttgggaaaaaccatatggtacgaatttatcttttaattccctatttaagtttttaggttattagaaatttgatgcagtttgttataagttataacttataacctatagttttcaaaaatatctattaaacccattaggcc cactttctcatttcgctcatggtttatgattgactctacaattaaactggaattaaataaaatgtatcacgtccgttcccccgtacgcttggtggacgccagttacccttcttaaatatcgtttaataatccctctcaattacgccactcacaggctaccgg ttcctcccgtttactttctcttaccatcagccatccgtaccaccgggttcaccggtcgatcctgtaatatcataaagctcgcgtccattgaaaaatctcctgtcttattgtgcttattgctcaatgcttttattccacgtgtctcatcagccaaagataaaa agggtaaaaacgacttctcgtagattctaagggcaatttaggaaattggaaaataccttatgaagaaagcagagcgtctgtagagatttctgtaacggggataaagtcgaaaaagtgaatatccattcacttgtcgccacgtaggaaaaaggcttttaatta cgatgtaacttgactcactagattgccatccccttattttaggaagttgtattaagtggaaattactggagaatttgaccaaggacaaaaagcttaataggaaggatacatgcgtgtccacttccgatgtcaaccaatcataccctgccaactcatatatcg gaagtcgaattgactattgtacccttgtgttctactgtcttagttatgacgtggacagcttctattggttgtagtgattttaaattcgtaaaacgggtaggggttaataagatctcatagtagcgcttgtctttttcttaattgtttatttatttcctataa aatattaatttaaatagctttccctattggatagcgaaatttattaaaaatttcattaaacgaaaacgaagtgtcgaaaaatgttttttctcaggaaaataaaaattatttattttttgggggtgtaaatacttttctagtgagatctgagcttg <TIS>g</TIS>gaaatggagattgtagaagaacaagctcctctcaccatttcttctt<BOXS2>cttct(+52)tctc</BOXS2> tctaaaagaaaagagacttcaccgattcttttttattattccttcccagattttctcgggaaattaattcttttcctcctctttcttctcacttgttgttgttccttaacactctcttcctagatctactattaactgatttcatttcacgactaaaccatc gaagtcttcggcaagatatggatttgtttctgttctattaaacttgtttcaatcgagaagtaaaaaag <INTRON>gtgagatttgtcgaccatcggaggcctcttatggtttgatgatatcgtttggttttcgatcgtctcaagtttttatttttggttctttctgaatctaaagcttctccctttctttgttcgctgtagtctctatgaattttttgagaaaaaaaac gtcgtgaaataacatgcaacaaagatccatttgagtttcttctctatttgtctattttgactttgtttttatggaaaaaaagattcgatgaagtttttatttgggattttctgatcggattttattgcttgttgttagtttccctgttctatttatagaagt agcgtctttacaaatcctctttgcttgattctttattgaaatctgtttgacttactggtttttcaaaaaacggttgattttgggaatcgttaagacatggtcttgttttcagacaaaaaccctcccttcttgtctgaaagtgactttagctgagatttatct taactggagtactattccgatctagtttctgtaaaatcaatggataagagaattaaaaagattctcttttggttttttatgatcgatttattagttcttttatgtaagtgatctttttgattgaatttttgattcttttgatgatgtttacag</INTRON> AAT<Rev_primer>CCGATTCCACAGATGGAACT</Rev_primer> <M>ATG</M> <PRIMER_F1>g(‑161/‑446)tccatatgtatcaaaatatgc</PRIMER_F1>tatttttggtctttcttaaggctt<FLC_CArGbox>TTTTCCAAAATAAGTAAA</FLC_CArGbox> ggatgaggtttcaagcgtccatcatatttgc<probeZ>gacacatatgactgactatttagctc <BOXS2>CTCCC(‑36/‑321)TCTT</BOXS2>tctttctcttattttattatctttctcc</probeZ>aag <TIS_TAIR>a(+1/‑285)</TIS_TAIR>aataaaatagaaaagaaaatatatatggtttcacaaacaccattaccataactacaacgagaagaggatcttttttaaggagaaaagcagagagagaagagacgagtgtgtgaagtttttttgtcttttgtt tcttttatt<F2>acacacaaatagatgaaacgagg</F2>aaagctacttcttttgctacttccataaaaaggttcttcctttcgcagagaatcaactttgatcat(+230)<CT_rich>cttcttccttctctttctttcttcttctccctccagtaatgcttatatagtctc <TIS_Coupland>c(+285/+1)</TIS_Coupland>tcctatatctctacctatacatacacaaaccctttatcctcgaaagcttcctcct</CT_rich> ggttaggtttttatcaaacccttttagccaatcggtaagatctcttcgtcatgatcttttcttttttcttttgctttgtactctgatggatctataaacttatatgggtttggtttcatttggttcgatttgatgtgtttggtttctttgtcctaaatctca tgaaaggaggttgcatccttcaattaaaccgataacaaaagtttccattacagacttatagatcagatactttagattgttttgctttttgggtacttaatctttcgttgacttcatcagtcttctcccacccaaacaaaaaagtcatatttcgatcatatc ttcatttttttaacctactctctttgattcatatatgaaatgggttgttttatgtgtgtgactaatcttgttattgaggtggttgcaccattgatctaccgttttcttcaatttttgaaaaaataattttattttttttctgtgt <Rev_Primer>gcaagggaaattaactaaagaagaagat <added_to_create_NcoI>cc</added_to_create_NcoI><M>ATG</M> G</Rev_Primer> <F2>a(‑583)ccaaatggtggaatggttcc</F2> gtttgat <BOXS2>cgtgc(‑551)tctc</BOXS2> <F3>a(‑546)tggtacaaacaatgagacc</F3> ccccaaaaaaaaaaaacccccgaggatgaaattaaaacaaataacacagcttgaacaaaacatcaaaaacagaggatcatcacagtaaatattaatacttgaacaaaacatcaaaaagataggatcatcacagtaaatattaatatgcataaagaagagaat caccacagtgaaaaccctaatcattttatattcctacgtgtcaaattatgaatggtcataatcagagtagagaaaaagaatgtcgatgaaagaaaaagtttgacttgttaagtcccaactgtcaatttcccagcaagacacatatcttcttttacatcacat tacatctacacataaatgctttattgcaaaaatagcgatataaaaaaagaatatacaaaaacctagtatttattttctagattctttactgttgtatatatagaagttgctcgagtggtcatttttacaataaagcaatctgctcaaaagagtaaagaaaga gagaaaaagagagtgatagagagagagagaaaaatagatt <TIS>A</TIS>T <R1>G.GAT.CCT.GAA.GGT.TTC.ACG.AGT</R1_protseq=MDPEGFTS> <Fusion>aat.ccc.gcg.gcc.atg</Fusion_protseq=NPAAM>
<Fwd_Primer>t(—1007)gcattttgcatattggttgg</Fwd_Primer> tccaaaaagatcaacgccacgatctatagaacatgcttcatttgatgttaagagttttgttggttcagcagctaaatttcagcctagcttccactttgtaggttcatcaatttccagagcaaagagaagatcgatacttaacttgaaattgaagaaaaggac atcattttagtttttttccttccaatttagcaggataaaatattgtaaaatgttccgtgttatttttgtgtttgcaattataaaattactatttttcctaaggttttattacaattgggtcaaattctttcgtgtacttattaaaacacactatatttaatt ttatctaatatatatatctttgaaattgtaagcacaatgttt <BOXS2>ctccc(‑620)tgtt</BOXS2> taaaggaaaaacagaaagtcaccttaaataaaattaaaatttctccgtgcatttaaccagaaaaaaacttgtctccatgcaaaaagaaaaattaaaaaaccaaaatacaatttgcattttgaaagaatatttaaaccctatatatagtcgttatagtgttac tgtagaaagtattaaggagttaaagattattctcctttaatatctattgagttctttggtctgatttcttaaccttaaaaacaataacaaaagtccgtacggtacggaaacaatgtaagctaaagggaggcacaaaactaacgaacgagttacaagcacagt aaaaagtagccaatgaggactcgacaacacatcaaatggtttatttcccaaacagcccttaaaactttatctccactctggtctcttcttccactcgtatgtagcttttgtgttttttttttctttcttttttttccacaaatatcatcgtctatgtattca cgtcacataccgtatttataccacatcacttacgtcactgtagactcacgcgaaacccaacaaaagtccataaaagaaaaaataaaaaaaataaaatagctattatcacattcatcaacacaaaagata <TIS>c</TIS>ccagagaga cataagaaagaaagagagagagagatactttggtcatttcagggttgtcgtttctctctcttgttcttgagattttgaagagagagagat <added_to_create_NcoI>cc</added_to_create_NcoI> <M>ATG<\M>G</Rev_Primer>
<Primer_F2>g(‑551)aatacttacaattattcttctcg</Primer_F2>at<BOXS2>cttcc(‑520)tctc</BOXS2>tttc <Primer_F3>c(‑496)ttaaatcctgcgtacaaatcc</Primer_F3> gtcgacgcaatacattacacagttgtcaattggttctcagctctaccaaaaacatctattgccaaaagaaaggt<Primer_F4>c(‑437)tatttgtacttcactgttacagc</Primer_F4>tgagaacattaaatataataagcaaatttgataaaa caaagggttctcaccttattccaaaagaatagtgtaaaatagggtaatagagaaatgttaataaaaggaaattaaaaatagatattttggttggttcagattttgtttcgtagatctacagggaaatctccgccgtcaatgcaaagcgaaggtgacacttgg ggaaggaccagtggtccgtacaatgttacttacccatttctcttcacgagacgtcgataatcaaattgtttattttcatatttttaagtccgcagttttattaaaaaatcatggacccgacattagtacgagatataccaatgagaagtcgacacgcaaatc ctaaagaaaccactgtggtttttgcaaacaagagaaaccagctttagcttttc <TIS>c</TIS> ctaaaaccactcttacccaaatctctccataaataaagatcccgagactcaaacacaagtctttttataaaggaaagaaagaaaaactttcctaattggttcataccaaagtctgagctcttctttatatctctcttgtagtttcttattgggggtctttgt tttgtttggttctttta<Rev_Primer>gagtaagaagtttcttaaaaaaggatcaaa</Rev_Primer>aATG
<Primer_F1>a(‑992)aagatggtccatactctcc</Primer_F1> ataatattaaaacacctgattcacaactcacgaaattcaacttgcaaactaataaagagaaaaacatagttaagtgtcaatacatactgtgatatattatctatcatacatatatgctttggttttcatttggttatcggttattaacctaaccgaaaccga aaccgaaatctaagacatataatattcaaccggttattttaagctatccaaacctgaaccgaaccatgtttttcggttcgattcggttcggttaatcggttagcggtttttttgcccaggcctactctgagcaataattgtatccggagttgtaatagaatc aaagtacgatgagagtgtttttatgacaaatatcttaatcttggccaattatatgttctactgaaattctttttgaattcatcgaccagtgagacttaaaaatagctttttattcgccgaggtatatatagctaggaattttgtcgaaatttagacgttagt gggttttgttcttcgtgacacaaaagatattctatatattaacgaaatctagcgatcgatatggtatttatataaagtcttggtcatagataggggttgaaacttgaaaccatgcatgatatgccaatgttgctgaagcagtcaatgttgctgaagaagtca aacgtaattatatagtgaataccaaaaaagtgatatttcttaattcaattaaatataattatagttttaaatcacctaaaataagttacttattaaaaccccccaaatttactttaatatagttggtgtacatgtttgagaaagcaaacaaaaagaaaaaga aaaagaaaaaaaaaagagaaagaggttagtacacataattgggaattaatgtctattgattcttttatctttctctctctctctaagacggaaaacccctataaatagatgtctcggtcgtctctttgtctcccaaatcactacaaatctctcttttcctct <TIS>a</TIS>agttaacaaaagaaa<Primer_Rev>ATG.GAG.AAT.ATG.GGA.ACT.AGA</Primer_Rev, seq=MENMGTR> <Fusion>aat.ccc.gcg.gcc.atg</Fusion_protseq=NPAAM> |