En Français.

sous la direction de M. Arkoun, L'islam et les musulmans en France depuis le Moyen Âge jusqu'à nos jours, Albin Michel 2006
- Humanisme et Islam. Combats et propositions, 2 ème éd. Vrin 2006
- Deux Epîtres de Miskawayh, édition critique, B.E.O, Damas, 1961
- Aspects de la pensée islamique classique, IPN, Paris 1963;
- L'humanisme arabe au IV/X siècle, 1°éd. J.Vrin, Paris 1970; 3°éd. 2005; trad. arabe: Naz‘at Al-ansana fî-l-fikr al-‘arabî, Dâr al-Sâqî, Beyrouth 1996.
- Traité d'Ethique, Trad., introd.et notes du Tahdhîb al-akhlâq de Miskawayh, 1e éd.1969; 2e éd.1988;
- Essais sur la pensée islamique, 1e éd. Maisonneuve & Larose, Paris 1973; 2e éd. 1984;
- La Pensée arabe, 1e éd. P.U.F., Paris 1975; 6e éd. 2005; Trad. en arabe, anglais, espagnol, suédois, italien ;
- L'islam, hier, demain, 1e éd. Buchet-Chastel, Paris 1978; 2e éd. 1982; trad. arabe, Beyrouth 1983;
- L'islam, religion et société, éd. Cerf, Paris 1982; version italienne, RAI 1980;
- Religion et laïcité: Une approche laïque de l'islam, L'Arbrelle, Centre Thomas More, 1989;
- Lectures du Coran, 1e éd. Paris 1982; 2e Aleef, Tunis 1991;
- Pour une critique de la Raison islamique, Paris 1984;
- L'islam, morale et politique, UNESCO-Desclée 1986;
- Ouvertures sur l'islam, 1e éd. J. Grancher 1989; 3e éd. L’islam. Approche critique, 1998; en allemand : Der Islam. Annäherung an eine Religion, Palmyra 1999.
- The Unthought in contemporary Islamic Thought, London 2002 ;
-De Manhattan à Bagdad. Au-delà du Bien et du Mal, Desclée De Brouwer 2003.
Combats pour l’Humanisme en contextes islamiques, Paris 2002
Penser l’Islam aujourd’hui, à paraître Paris 2008.

en Néerlandais

- Islam in Discussie, 24 vragen over de islam, éd. Uitgeverij Contact, Amsterdam 1993;
- Islam & De Democratie; Een ontmoeting, en collaboration avec Frits Bolkestein, Uitgeverij Contact, Amsterdam 1994. --Plusieurs articles et interviews dans Revues et journaux.
en Indonésien:
- Nalar islami dan nalar modern: Berbagai Tantangan dan jalan Baru, trans. Johan H. Meuleman, INIS, Jakarta 1994, 318 p.
- Berbagai Pembacaan Quran, trans. Johan H. Meuleman, INIS, Jakarta 1997, 256 p.

En Arabe:

- Al-Fikr al-'arabiyy, éd.'Uwaydat, Beyrouth 1979;
- Al-Islâm: Asâla wa Mumârasa, Beyrouth 1986;
- Ta'rîkhiyyat al-fikr al-'arabiyy al-islâmiyy, éd.Markaz al-inmâ' al-qawmiyy, Beyrouth 1986;
- Al-Fikr al-islâmiyy: Qirâ'a 'ilmiyya, éd. Markaz..., 1987;
- Al-islâm: al-Akhlâq wal-Siyâsa, éd. Markaz..., 1988;
- Al-Islâm: Naqd wa-jtihâd, éd. Dâr al-Sâqî, Beyrouth 1990;
- Al-'almana wa-l-dîn, Dâr al-Sâqî 1990;
- Mina-l-ijtihâd ilâ naqd al-'aql al-islâmî, Dâr al-Sâqî 1991;
- Min Faysal al-Tafriqa ilâ Fasl-al-Maqâl: Ayna huwa-l-Fikr al-islâmiyy al-mu'âsir, Dâr al-Sâqî 1993;
- Al-Islâm, Urubbâ, wal-Gharb: Rihânât al-ma'nâ wa Irâdât al-Haymana, Dâr al-Sâqî 1995;
- Naz‘at al-Ansana fî-l-fikr al-‘arabiyy, Dâr al-Sâqî 1997 ;
- Qadâyâ fî Naqd al-Fikr al-dînî, Dâr al-Talî‘a, Beyrouth 1998 ;
- Al-Fikr al-usûlî wal-stihâlat al-Ta’sîl, Dâr al-Sâqî 1999.
- Ma‘ârik min ajli-l-ansana fî-l-siyâqât al-islâmiyya, Dâr al-sâqî, 2001.
- Min al-Tafsîr al-mawrûth ilâ tahlîl al-khitâb al-dînî, Dâr al-Talî‘a, Beyrouth 2001.

en Indonésien

- Nalar islami dan nalar modern: Berbagai Tantangan dan jalan Baru, trans. Johan H. Meuleman, INIS, Jakarta 1994. Berbagai Pembacaan Quran, trans. Johan H. Meuleman, INIS, Jakarta 1997.

En Anglais :

- Rethinking Islam: Common questions, Uncommon answers, Westvew Press, Boulder 1994
- Arab Thought, éd. S.Chand, New-Delhi 1988;
- Rethinking Islam today, Center for Contemporary Arab Studies, Georgetown University, Washington 1987;
- The concept of Revelation: from Ahl al-Kitâb to the Societies of the Book-book, Claremont Graduate School, Ca.1988;
- The Unthought in Contemporary Islamic Thought, London,  2003
- Islam, Europe and the West, in Islam and Modernity, edited by J. Cooper, I. B. Tauris 1998
Islam: to Reform or to Subvert, London 2006

The Answers of Applied islamology, in Theory, Culture, Society, vol. 24, Number 2, March 2007