About Me

Kazuhiro Takemoto
Assistant Prof.
Dept. Biosci. Bioinform.
Kyushu Inst. Tech.
竹本 和広
九州工大 生命情報工 助教
JSTさきがけ研究者（兼任）

Contact

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〒820-8502 福岡県飯塚市川津680-4
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Fax: +81-948-29-7801
E-mail: takemoto[AT] bio.kyutech.ac.jp
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Presentation

Talk

  1. 竹本和広. ネットワークから捉える代謝システムの形成と適応. 日本農芸化学会2012年度大会（シンポジウム「ゲノムスケールの数理モデリングに基づく代謝システムの理解とデザイン」）, 4SY21-5 (2012年3月25日, 京都女子大学). 招待
  2. 竹本和広. 代謝ネットワークはどのように形成されてきたのか. 非線形科学セミナー (2012年3月13日, 神戸大学 理学部 地球惑星科学科 非線形科学研究室).
  3. 竹本和広. 代謝系—ネットワークからの理解. 数学連携推進室研究会「ネットワークから見る生命」(2011年12月21〜22日, 東北大学青葉山キャンパス). 招待
  4. 竹本和広. 代謝ネットワークにおけるシャペロニン基質酵素の特徴的な分布パタン. 第12回極限環境生物学会年会, O-12 (2011年11月27〜28日, 長崎大学良順会館).
  5. Takemoto, K., Tamura, T., Cong, Y., Ching, W.-K., Vert, J.-P. and Akutsu, T. Estimating metabolic network robustness using branching process approximation. The 2011 Joint Conference of Chem-Bio Informatics Society and Japanese Society for Bioinformatics (CBI/JSBi2011), JSBi-3 (8-10 October 2011, Kobe International Conference Center, Japan).
  6. 竹本和広. ネットワーク理論に基づく代謝系の解析とモデル化. 第6回メタボロームシンポジウム, S-16 (2011年10月13〜14日, 大阪大学コンベンションセンター). 招待.
  7. Takemoto, K. Characteristic Distribution Pattern of Chaperonin Substrates on the Metabolic Network. The 1st Annual Meeting for Whole-Organism Science Society Joint Meeting with The 10th Annual Meeting of Structural-Biological Whole Cell Project of Thermus thermopiles HB8 (19-21 August 2011, RIKEN SPring-8 Center, Japan).
  8. 竹本和広. 代謝系形成の数理モデル—代謝経路構造と代謝物種間分布の視点から. 第27回数理医学セミナー (2010年10月22日, 大阪大学 豊中キャンパス). 招待.
  9. 竹本和広. ネットワーク形成—代謝系と生態系を例にして. 合原最先端数理モデルプロジェクトセミナー (2010年9月13日, 東京大学 生産技術研究所). 招待.
  10. 竹本和広. 始原菌代謝経路の比較解析. 日本Archaea研究会第23回講演会 (2010年7月9〜10日, 名古屋大学ベンチャー・ビジネス・ラボラトリー).
  11. 竹本和広. 古細菌代謝の再構築—形成・環境適応機構の理解に向けて. 生命情報科学研究セミナー (2010年6月3日, 産総研臨海副都心センター別館). 招待.
  12. 竹本和広. 単純な進化過程を通して獲得される二部関係の構造. 日本物理学会第65回年次大会, 23pEL-5 (2010年3月20～23日, 岡山大学津島キャンパス).
  13. 竹本和広. 代謝系の形成ダイナミクス—ネットワーク理論からのアプローチ. 明治大学グローバルCOEプログラム【現象数理学の形成と発展】研究会「生体内ネットワーク構造とダイナミクスの様相」(2010年1月29～30日, 明治大学生田キャンパス). 招待.
  14. Takemoto, K. and Arita, M. Architecture of flavonoid distributions across plant species. The 3rd Joint Workshop on Profiling Technologies & Bioinformatics (16-18 September 2009, Umeå University, Sweden).
  15. Takemoto, K. and Arita, M. Analysis of Species-Flavonoid Relationship using Bipartite Networks. The 2008 Annual Conference of Japanese Society for Bioinformatics (JSBi2008), P054/T14 (15-16 December 2008, Senri Lifescience Center Building, Osaka, Japan).
  16. 竹本和広, ホセ・C・ナチェル, 阿久津達也. 原核生物における代謝ネットワーク構造と生育温度の関係. 日本物理学会第62回年次大会, 21aTP-11 (2007年9月21～24日, 北海道大学札幌キャンパス).
  17. 竹本和広, ホセ・C・ナチェル, 阿久津達也. 生育温度による代謝ネットワーク構造の差異. 情報処理学会第10回バイオ情報学研究会 (2007年9月13～14日, はこだて未来大学).
  18. Takemoto, K. Structural transition in prokaryotic metabolic networks with growth temperature. 21st COE Program -Knowledge Information Infrastructure for Genome Science- Open International Symposium "From Genomics to Chemical Genomics", O-03 (29-30 January 2007, Shiran-Kaikan, Kyoto, Japan).
  19. 竹本和広, ホセ・カルロス・ナチェル, 阿久津達也. 原核生物の代謝ネットワークにおける構造の乱雑さと生育温度の関係. 日本ソフトウェア科学会 ネットワークが創発する知能研究会第2回国内ワークショップ (JWEIN2006) (2006年9月27～29日, ニュー阿寒ホテル).
  20. 竹本和広. 生物ネットワークの構造特性を示す数理モデルについて. ミニ研究会「ネットワークの構造とダイナミクス」short talk (2006年4月19～20日, 基礎生物学研究所).
  21. 竹本和広, 大澤智興. 成長するネットワークの半径維持. 日本物理学会第61回年次大会, 30pXH-9 (2006年3月27～30日, 愛媛大学・松山大学).
  22. 竹本和広, 大澤智興. 重複するサブネットワークが形成する複雑ネットワークの構造特性. 日本物理学会第60回年次大会, 25pYF-3 (2005年3月24～27日, 東京理科大学野田キャンパス).

Poster

  1. 竹本和広. 好熱菌における代謝ネットワーク構造の生育温度依存性. 第12回極限環境生物学会年会, P-97 (2011年11月27〜28日, 長崎大学良順会館).
  2. Takemoto, K. Growth Temperature Dependence of Metabolic Network Structures in Thermophiles. The 11th International Conference on Thermophiles Research (Thermophiles2011), PA-119 (11-16 September 2011, Big Sky, MT, USA).
  3. Takemoto, K. Characteristic Distribution Pattern of Chaperonin Substrates on the Metabolic Network of Escherichia coli. The 12th International Conference on Systems Biology (ICSB2011), P058 (28 August - 1 September 2011, Congress Center Rosengarten Mannheim, Germany).
  4. Takemoto, K. A simple evolving network model for bipartite relationships: A case study of metabolite distributions among species and plant-pollinator mutualistic networks. NetSci2011: The International School and Conference on Network Science (6-10 June 2011, Budapest, Hungary).
  5. Takemoto, K. Unique Metabolic Pathway of Hyperthermophilic Archaea and Its Evolution. The Ninth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2011), 8 (11-14 January 2011, Songdo Convensia, Korea)
  6. Takemoto, K. Diversity of Central Metabolism in Archaea and Its Possible Evolutionary Origin. The 2010 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics (JSBi2010), P03 (13-15 December 2010, Centennial Hall Kyushu University School of Medicine).
  7. 竹本和広. 超好熱性古細菌 Thermococcus kodakarensis KOD1 の代謝ネットワーク再構築. 第11回極限環境生物学会年会, P-6 (2010年11月15〜16日, 京都大学宇治キャンパス).
  8. Takemoto, K. Diversification of Archaeal Central Metabolism. The 11th International Conference on Systems Biology (ICSB2010), P01.751 (10-16 October 2010, Edinburgh, UK).
  9. 竹本和広. 古細菌における糖代謝経路の比較解析. 第5回メタボロームシンポジウム (2010年9月9〜11日, グランド・エル・サン, 鶴岡).
  10. Takemoto, K. How Do Metabolic Networks Expand: From the Perspective of Enzymatic Age and Structural Complexity of Chemical Compounds. Asian Young Researchers Conference on Computational and Omics Biology (10-12 March 2010, National Cheng Kung University, Taiwan).
  11. Takemoto, K. Evolution of Metabolite Distributions Across Plant Species. The Eighth Asia Pacific Bioinformatics Conference (APBC2010), A137 (18-21 January 2010, Indian Institute of Science, Bangalore, India). Received the Best Poster Award. 
  12. Takemoto, K., Nacher, J.C. and Akutsu, T. Structural Difference with Temperature in Prokaryotic Metabolic Networks and a Hypothesis of Its Origin. The 18th International Conference on Genome Informatics (GIW2007), #1 (3-5 December 2007, Matrix, 30 Biopolis Street, Singapore).
  13. Takemoto, K., Nacher, J.C. and Akutsu, T. Structural Difference with Temperature in Prokaryotic Metabolic Networks. The 7th Annual International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB2007), P003 (31 July - 2 August 2007, Inst. Med. Sci., The University of Tokyo, Tokyo, Japan).
  14. Takemoto, K., Nacher, J.C. and Akutsu, T. Structural transition in prokaryotic metabolic networks with growth temperature. The 7th International Conference on Systems Biology (ICSB2006), FN39 (8-13 October 2006, Pacifico Yokohama, Yokohama, Japan).
  15. Takemoto, K., Oosawa, C. and Akutsu, T. Global structure of combined cliques in hierarchical networks. Japanese-Korean Joint Meeting for Mathematical Biology, 1P-13 (16-18 September 2006, Kyushu University Hakozaki Campus, Fukuoka, Japan).
  16. Takemoto, K. and Oosawa, C. Power-law Correlations of Connectivities in Biomolecluar Networks. The 15th International Conference on Genome Informatics (GIW2004), P066 (13-15 December 2004, Pacifico Yokohama, Yokohama, Japan).
  17. Takemoto, K. and Oosawa, C. M3: Merging Module Model for a Network with Scale-Free Properties and Modularity. The 14th International Conference on Genome Informatics (GIW2003), P079 (14-17 December 2003, Pacifico Yokohama, Yokohama, Japan).

Lecture

  1. ゲノムリテラシー講座「バイオインフォマティクスの基礎：パスウェイ解析・システム生物学」(2010年9月7日, 独立行政法人科学技術振興機構住宅棟1階会議室).