Fitting the finite-state automata platform for mining gene functions from biological scientific literature I.Jilani, N.Grabar, M.C.Jaulent 2006 [PDF]

El artículo presenta la adaptación de la plataforma Unitex para la detección de funciones de genes a partir de documentos biológicos.

El trabajo presenta como objetivos detectar funciones de genes en la literatura. Parten listas de nombres de de especies y sus alias, genes para esas especies, y obtienen los alias utilizando WormBase, FlyBase. Además parten de la Gene Ontology para las descripciones funcionales de los genes. Modifican la interface Unixtex (esencialmente ponen arriba una capa para mostrar resultados). Utilizan transductores. Los patrones son construidos a mano. También hablan de identificar grados de seguridad en las afirmaciones, pero no se exitienden mucho. En las conclusiones presentan como problema el de la ambigüedad de los nombres de los genes.